Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B649

Trav13-2, T cell receptor alpha variable 13-2 (Fragment), mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav13-2A0A075B649 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav13-2A0A075B649 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav13-2A0A075B649 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav13-2A0A075B649 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav13-2A0A075B649 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav13-2A0A075B649 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Trav13-2A0A075B649 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav13-2A0A075B649 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav13-2A0A075B649 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav13-2A0A075B649 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav13-2A0A075B649 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav13-2A0A075B649 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav13-2A0A075B649 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav13-2A0A075B649 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav13-2A0A075B649 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav13-2A0A075B649 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Trav13-2A0A075B649 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Trav13-2A0A075B649 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Trav13-2A0A075B649 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav13-2A0A075B649 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav13-2A0A075B649 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav13-2A0A075B649 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Trav13-2A0A075B649 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Trav13-2A0A075B649 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trav13-2A0A075B649 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Trav13-2A0A075B649 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav13-2A0A075B649 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav13-2A0A075B649 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav13-2A0A075B649 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Trav13-2A0A075B649 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav13-2A0A075B649 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav13-2A0A075B649 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav13-2A0A075B649 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav13-2A0A075B649 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav13-2A0A075B649 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav13-2A0A075B649 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav13-2A0A075B649 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav13-2A0A075B649 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav13-2A0A075B649 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trav13-2A0A075B649 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trav13-2A0A075B649 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trav13-2A0A075B649 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trav13-2A0A075B649 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trav13-2A0A075B649 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trav13-2A0A075B649 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trav13-2A0A075B649 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trav13-2A0A075B649 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trav13-2A0A075B649 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trav13-2A0A075B649 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trav13-2A0A075B649 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trav13-2A0A075B649 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trav13-2A0A075B649 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trav13-2A0A075B649 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trav13-2A0A075B649 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trav13-2A0A075B649 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trav13-2A0A075B649 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trav13-2A0A075B649 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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