Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Top3bQ9Z321 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Top3bQ9Z321 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Top3bQ9Z321 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Top3bQ9Z321 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Top3bQ9Z321 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Top3bQ9Z321 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Top3bQ9Z321 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Top3bQ9Z321 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Top3bQ9Z321 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Top3bQ9Z321 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Top3bQ9Z321 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Top3bQ9Z321 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Top3bQ9Z321 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Top3bQ9Z321 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Top3bQ9Z321 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Top3bQ9Z321 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Top3bQ9Z321 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Top3bQ9Z321 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Top3bQ9Z321 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Top3bQ9Z321 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Top3bQ9Z321 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Top3bQ9Z321 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Top3bQ9Z321 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Top3bQ9Z321 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Top3bQ9Z321 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Top3bQ9Z321 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Top3bQ9Z321 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Top3bQ9Z321 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Top3bQ9Z321 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Top3bQ9Z321 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Top3bQ9Z321 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Top3bQ9Z321 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Top3bQ9Z321 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Top3bQ9Z321 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Top3bQ9Z321 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Top3bQ9Z321 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Top3bQ9Z321 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Top3bQ9Z321 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Top3bQ9Z321 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Top3bQ9Z321 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Top3bQ9Z321 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Top3bQ9Z321 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Top3bQ9Z321 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Top3bQ9Z321 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Top3bQ9Z321 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Top3bQ9Z321 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Top3bQ9Z321 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Top3bQ9Z321 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Top3bQ9Z321 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Top3bQ9Z321 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Top3bQ9Z321 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Top3bQ9Z321 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Top3bQ9Z321 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Top3bQ9Z321 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Top3bQ9Z321 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Top3bQ9Z321 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Top3bQ9Z321 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Top3bQ9Z321 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Top3bQ9Z321 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Top3bQ9Z321 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Top3bQ9Z321 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Top3bQ9Z321 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Top3bQ9Z321 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Top3bQ9Z321 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Top3bQ9Z321 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Top3bQ9Z321 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Top3bQ9Z321 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Top3bQ9Z321 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Top3bQ9Z321 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Top3bQ9Z321 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Top3bQ9Z321 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Top3bQ9Z321 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Top3bQ9Z321 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Top3bQ9Z321 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Top3bQ9Z321 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Top3bQ9Z321 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Top3bQ9Z321 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Top3bQ9Z321 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Top3bQ9Z321 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Top3bQ9Z321 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Top3bQ9Z321 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Top3bQ9Z321 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Top3bQ9Z321 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Top3bQ9Z321 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Top3bQ9Z321 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Top3bQ9Z321 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Top3bQ9Z321 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Top3bQ9Z321 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Top3bQ9Z321 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Top3bQ9Z321 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Top3bQ9Z321 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Top3bQ9Z321 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Top3bQ9Z321 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Top3bQ9Z321 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Top3bQ9Z321 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Top3bQ9Z321 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Top3bQ9Z321 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Top3bQ9Z321 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Top3bQ9Z321 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms