Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cldn8Q9Z260 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cldn8Q9Z260 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cldn8Q9Z260 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cldn8Q9Z260 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cldn8Q9Z260 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Cldn8Q9Z260 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cldn8Q9Z260 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cldn8Q9Z260 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cldn8Q9Z260 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cldn8Q9Z260 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cldn8Q9Z260 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn8Q9Z260 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn8Q9Z260 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn8Q9Z260 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn8Q9Z260 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn8Q9Z260 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn8Q9Z260 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn8Q9Z260 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn8Q9Z260 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn8Q9Z260 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn8Q9Z260 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn8Q9Z260 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn8Q9Z260 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn8Q9Z260 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn8Q9Z260 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn8Q9Z260 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn8Q9Z260 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn8Q9Z260 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn8Q9Z260 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn8Q9Z260 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn8Q9Z260 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn8Q9Z260 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn8Q9Z260 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn8Q9Z260 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn8Q9Z260 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn8Q9Z260 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cldn8Q9Z260 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cldn8Q9Z260 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cldn8Q9Z260 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cldn8Q9Z260 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cldn8Q9Z260 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cldn8Q9Z260 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cldn8Q9Z260 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cldn8Q9Z260 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn8Q9Z260 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn8Q9Z260 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn8Q9Z260 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn8Q9Z260 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn8Q9Z260 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn8Q9Z260 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn8Q9Z260 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn8Q9Z260 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn8Q9Z260 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn8Q9Z260 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn8Q9Z260 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn8Q9Z260 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn8Q9Z260 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn8Q9Z260 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn8Q9Z260 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn8Q9Z260 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn8Q9Z260 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn8Q9Z260 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn8Q9Z260 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn8Q9Z260 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn8Q9Z260 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn8Q9Z260 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn8Q9Z260 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn8Q9Z260 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn8Q9Z260 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn8Q9Z260 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn8Q9Z260 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn8Q9Z260 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn8Q9Z260 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn8Q9Z260 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn8Q9Z260 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn8Q9Z260 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn8Q9Z260 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn8Q9Z260 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn8Q9Z260 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn8Q9Z260 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn8Q9Z260 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn8Q9Z260 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn8Q9Z260 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn8Q9Z260 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn8Q9Z260 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn8Q9Z260 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn8Q9Z260 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn8Q9Z260 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn8Q9Z260 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn8Q9Z260 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cldn8Q9Z260 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cldn8Q9Z260 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cldn8Q9Z260 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cldn8Q9Z260 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cldn8Q9Z260 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn8Q9Z260 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn8Q9Z260 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn8Q9Z260 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn8Q9Z260 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms