Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Skp2Q9Z0Z3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Skp2Q9Z0Z3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Skp2Q9Z0Z3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Skp2Q9Z0Z3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Skp2Q9Z0Z3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Skp2Q9Z0Z3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Skp2Q9Z0Z3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Skp2Q9Z0Z3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Skp2Q9Z0Z3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Skp2Q9Z0Z3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Skp2Q9Z0Z3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Skp2Q9Z0Z3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Skp2Q9Z0Z3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Skp2Q9Z0Z3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Skp2Q9Z0Z3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Skp2Q9Z0Z3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Skp2Q9Z0Z3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Skp2Q9Z0Z3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Skp2Q9Z0Z3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Skp2Q9Z0Z3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Skp2Q9Z0Z3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Skp2Q9Z0Z3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Skp2Q9Z0Z3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Skp2Q9Z0Z3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Skp2Q9Z0Z3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Skp2Q9Z0Z3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Skp2Q9Z0Z3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Skp2Q9Z0Z3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Skp2Q9Z0Z3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Skp2Q9Z0Z3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Skp2Q9Z0Z3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Skp2Q9Z0Z3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Skp2Q9Z0Z3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Skp2Q9Z0Z3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Skp2Q9Z0Z3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Skp2Q9Z0Z3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Skp2Q9Z0Z3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Skp2Q9Z0Z3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Skp2Q9Z0Z3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Skp2Q9Z0Z3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Skp2Q9Z0Z3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Skp2Q9Z0Z3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Skp2Q9Z0Z3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Skp2Q9Z0Z3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Skp2Q9Z0Z3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Skp2Q9Z0Z3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Skp2Q9Z0Z3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Skp2Q9Z0Z3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Skp2Q9Z0Z3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Skp2Q9Z0Z3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Skp2Q9Z0Z3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Skp2Q9Z0Z3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Skp2Q9Z0Z3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Skp2Q9Z0Z3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Skp2Q9Z0Z3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Skp2Q9Z0Z3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Skp2Q9Z0Z3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Skp2Q9Z0Z3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Skp2Q9Z0Z3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Skp2Q9Z0Z3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Skp2Q9Z0Z3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Skp2Q9Z0Z3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Skp2Q9Z0Z3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Skp2Q9Z0Z3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Skp2Q9Z0Z3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Skp2Q9Z0Z3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Skp2Q9Z0Z3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Skp2Q9Z0Z3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Skp2Q9Z0Z3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Skp2Q9Z0Z3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Skp2Q9Z0Z3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Skp2Q9Z0Z3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Skp2Q9Z0Z3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Skp2Q9Z0Z3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Skp2Q9Z0Z3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Skp2Q9Z0Z3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Skp2Q9Z0Z3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Skp2Q9Z0Z3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Skp2Q9Z0Z3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Skp2Q9Z0Z3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Skp2Q9Z0Z3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Skp2Q9Z0Z3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Skp2Q9Z0Z3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Skp2Q9Z0Z3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Skp2Q9Z0Z3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skp2Q9Z0Z3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skp2Q9Z0Z3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skp2Q9Z0Z3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skp2Q9Z0Z3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skp2Q9Z0Z3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skp2Q9Z0Z3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skp2Q9Z0Z3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skp2Q9Z0Z3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skp2Q9Z0Z3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skp2Q9Z0Z3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skp2Q9Z0Z3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skp2Q9Z0Z3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skp2Q9Z0Z3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Skp2Q9Z0Z3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms