Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Y1

Dctn3, Dynactin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn3Q9Z0Y1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dctn3Q9Z0Y1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dctn3Q9Z0Y1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dctn3Q9Z0Y1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dctn3Q9Z0Y1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dctn3Q9Z0Y1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dctn3Q9Z0Y1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dctn3Q9Z0Y1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dctn3Q9Z0Y1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dctn3Q9Z0Y1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dctn3Q9Z0Y1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dctn3Q9Z0Y1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dctn3Q9Z0Y1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dctn3Q9Z0Y1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dctn3Q9Z0Y1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dctn3Q9Z0Y1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Dctn3Q9Z0Y1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Dctn3Q9Z0Y1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Dctn3Q9Z0Y1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Dctn3Q9Z0Y1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dctn3Q9Z0Y1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dctn3Q9Z0Y1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dctn3Q9Z0Y1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dctn3Q9Z0Y1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dctn3Q9Z0Y1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dctn3Q9Z0Y1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dctn3Q9Z0Y1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dctn3Q9Z0Y1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dctn3Q9Z0Y1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dctn3Q9Z0Y1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dctn3Q9Z0Y1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dctn3Q9Z0Y1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dctn3Q9Z0Y1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dctn3Q9Z0Y1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dctn3Q9Z0Y1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dctn3Q9Z0Y1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Dctn3Q9Z0Y1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dctn3Q9Z0Y1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dctn3Q9Z0Y1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dctn3Q9Z0Y1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dctn3Q9Z0Y1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dctn3Q9Z0Y1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dctn3Q9Z0Y1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dctn3Q9Z0Y1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dctn3Q9Z0Y1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dctn3Q9Z0Y1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dctn3Q9Z0Y1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dctn3Q9Z0Y1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dctn3Q9Z0Y1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dctn3Q9Z0Y1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dctn3Q9Z0Y1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dctn3Q9Z0Y1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dctn3Q9Z0Y1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dctn3Q9Z0Y1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dctn3Q9Z0Y1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dctn3Q9Z0Y1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dctn3Q9Z0Y1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dctn3Q9Z0Y1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dctn3Q9Z0Y1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dctn3Q9Z0Y1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dctn3Q9Z0Y1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dctn3Q9Z0Y1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dctn3Q9Z0Y1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dctn3Q9Z0Y1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dctn3Q9Z0Y1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dctn3Q9Z0Y1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dctn3Q9Z0Y1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dctn3Q9Z0Y1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dctn3Q9Z0Y1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dctn3Q9Z0Y1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Dctn3Q9Z0Y1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dctn3Q9Z0Y1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dctn3Q9Z0Y1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dctn3Q9Z0Y1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dctn3Q9Z0Y1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dctn3Q9Z0Y1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dctn3Q9Z0Y1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dctn3Q9Z0Y1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dctn3Q9Z0Y1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dctn3Q9Z0Y1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dctn3Q9Z0Y1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dctn3Q9Z0Y1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dctn3Q9Z0Y1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dctn3Q9Z0Y1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dctn3Q9Z0Y1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dctn3Q9Z0Y1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dctn3Q9Z0Y1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dctn3Q9Z0Y1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Dctn3Q9Z0Y1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dctn3Q9Z0Y1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dctn3Q9Z0Y1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dctn3Q9Z0Y1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dctn3Q9Z0Y1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dctn3Q9Z0Y1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms