Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnip1Q9WUU8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnip1Q9WUU8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnip1Q9WUU8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnip1Q9WUU8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnip1Q9WUU8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnip1Q9WUU8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnip1Q9WUU8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnip1Q9WUU8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnip1Q9WUU8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnip1Q9WUU8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnip1Q9WUU8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnip1Q9WUU8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnip1Q9WUU8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnip1Q9WUU8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnip1Q9WUU8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnip1Q9WUU8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnip1Q9WUU8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnip1Q9WUU8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnip1Q9WUU8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnip1Q9WUU8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnip1Q9WUU8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnip1Q9WUU8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnip1Q9WUU8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnip1Q9WUU8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnip1Q9WUU8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnip1Q9WUU8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnip1Q9WUU8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnip1Q9WUU8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnip1Q9WUU8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnip1Q9WUU8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnip1Q9WUU8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnip1Q9WUU8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnip1Q9WUU8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnip1Q9WUU8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnip1Q9WUU8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnip1Q9WUU8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnip1Q9WUU8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnip1Q9WUU8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnip1Q9WUU8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnip1Q9WUU8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnip1Q9WUU8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnip1Q9WUU8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnip1Q9WUU8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tnip1Q9WUU8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tnip1Q9WUU8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnip1Q9WUU8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnip1Q9WUU8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnip1Q9WUU8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnip1Q9WUU8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnip1Q9WUU8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnip1Q9WUU8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnip1Q9WUU8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnip1Q9WUU8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnip1Q9WUU8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnip1Q9WUU8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnip1Q9WUU8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnip1Q9WUU8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnip1Q9WUU8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnip1Q9WUU8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnip1Q9WUU8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnip1Q9WUU8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnip1Q9WUU8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnip1Q9WUU8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnip1Q9WUU8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnip1Q9WUU8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnip1Q9WUU8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnip1Q9WUU8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnip1Q9WUU8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnip1Q9WUU8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnip1Q9WUU8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnip1Q9WUU8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnip1Q9WUU8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnip1Q9WUU8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnip1Q9WUU8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnip1Q9WUU8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnip1Q9WUU8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnip1Q9WUU8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnip1Q9WUU8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnip1Q9WUU8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnip1Q9WUU8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnip1Q9WUU8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnip1Q9WUU8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnip1Q9WUU8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnip1Q9WUU8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnip1Q9WUU8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnip1Q9WUU8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnip1Q9WUU8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnip1Q9WUU8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnip1Q9WUU8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnip1Q9WUU8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnip1Q9WUU8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnip1Q9WUU8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnip1Q9WUU8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnip1Q9WUU8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnip1Q9WUU8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnip1Q9WUU8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnip1Q9WUU8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnip1Q9WUU8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnip1Q9WUU8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms