Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU20

Mthfr, Methylenetetrahydrofolate reductase, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MthfrQ9WU20 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
MthfrQ9WU20 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MthfrQ9WU20 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MthfrQ9WU20 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MthfrQ9WU20 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MthfrQ9WU20 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MthfrQ9WU20 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MthfrQ9WU20 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MthfrQ9WU20 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MthfrQ9WU20 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
MthfrQ9WU20 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MthfrQ9WU20 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MthfrQ9WU20 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MthfrQ9WU20 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms