Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sema6cQ9WTM3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sema6cQ9WTM3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sema6cQ9WTM3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sema6cQ9WTM3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sema6cQ9WTM3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sema6cQ9WTM3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sema6cQ9WTM3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sema6cQ9WTM3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sema6cQ9WTM3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sema6cQ9WTM3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Sema6cQ9WTM3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sema6cQ9WTM3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sema6cQ9WTM3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sema6cQ9WTM3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sema6cQ9WTM3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sema6cQ9WTM3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sema6cQ9WTM3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sema6cQ9WTM3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Sema6cQ9WTM3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sema6cQ9WTM3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sema6cQ9WTM3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sema6cQ9WTM3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sema6cQ9WTM3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sema6cQ9WTM3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sema6cQ9WTM3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sema6cQ9WTM3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sema6cQ9WTM3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sema6cQ9WTM3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sema6cQ9WTM3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sema6cQ9WTM3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sema6cQ9WTM3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Sema6cQ9WTM3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sema6cQ9WTM3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sema6cQ9WTM3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sema6cQ9WTM3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Sema6cQ9WTM3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sema6cQ9WTM3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema6cQ9WTM3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema6cQ9WTM3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema6cQ9WTM3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema6cQ9WTM3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema6cQ9WTM3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema6cQ9WTM3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema6cQ9WTM3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema6cQ9WTM3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema6cQ9WTM3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema6cQ9WTM3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema6cQ9WTM3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema6cQ9WTM3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema6cQ9WTM3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema6cQ9WTM3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema6cQ9WTM3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema6cQ9WTM3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema6cQ9WTM3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema6cQ9WTM3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema6cQ9WTM3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema6cQ9WTM3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema6cQ9WTM3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema6cQ9WTM3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema6cQ9WTM3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema6cQ9WTM3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema6cQ9WTM3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema6cQ9WTM3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema6cQ9WTM3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema6cQ9WTM3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema6cQ9WTM3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema6cQ9WTM3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema6cQ9WTM3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sema6cQ9WTM3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sema6cQ9WTM3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sema6cQ9WTM3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sema6cQ9WTM3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sema6cQ9WTM3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Sema6cQ9WTM3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sema6cQ9WTM3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sema6cQ9WTM3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sema6cQ9WTM3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sema6cQ9WTM3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sema6cQ9WTM3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema6cQ9WTM3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema6cQ9WTM3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema6cQ9WTM3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema6cQ9WTM3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema6cQ9WTM3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema6cQ9WTM3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema6cQ9WTM3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sema6cQ9WTM3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sema6cQ9WTM3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sema6cQ9WTM3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sema6cQ9WTM3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sema6cQ9WTM3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sema6cQ9WTM3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sema6cQ9WTM3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sema6cQ9WTM3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sema6cQ9WTM3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sema6cQ9WTM3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sema6cQ9WTM3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sema6cQ9WTM3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sema6cQ9WTM3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms