Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
PplQ9R269 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PplQ9R269 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PplQ9R269 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PplQ9R269 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PplQ9R269 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PplQ9R269 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PplQ9R269 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PplQ9R269 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PplQ9R269 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PplQ9R269 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PplQ9R269 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PplQ9R269 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PplQ9R269 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PplQ9R269 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PplQ9R269 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PplQ9R269 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PplQ9R269 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PplQ9R269 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PplQ9R269 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PplQ9R269 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PplQ9R269 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PplQ9R269 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PplQ9R269 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PplQ9R269 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PplQ9R269 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PplQ9R269 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PplQ9R269 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PplQ9R269 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PplQ9R269 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PplQ9R269 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PplQ9R269 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PplQ9R269 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PplQ9R269 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PplQ9R269 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PplQ9R269 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PplQ9R269 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PplQ9R269 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PplQ9R269 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PplQ9R269 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PplQ9R269 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PplQ9R269 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PplQ9R269 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PplQ9R269 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PplQ9R269 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PplQ9R269 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PplQ9R269 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PplQ9R269 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PplQ9R269 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PplQ9R269 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PplQ9R269 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PplQ9R269 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PplQ9R269 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PplQ9R269 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PplQ9R269 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PplQ9R269 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PplQ9R269 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PplQ9R269 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PplQ9R269 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PplQ9R269 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PplQ9R269 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PplQ9R269 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PplQ9R269 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PplQ9R269 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PplQ9R269 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PplQ9R269 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PplQ9R269 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PplQ9R269 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PplQ9R269 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PplQ9R269 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PplQ9R269 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PplQ9R269 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PplQ9R269 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PplQ9R269 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PplQ9R269 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PplQ9R269 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PplQ9R269 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PplQ9R269 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PplQ9R269 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PplQ9R269 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PplQ9R269 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PplQ9R269 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PplQ9R269 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PplQ9R269 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PplQ9R269 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PplQ9R269 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PplQ9R269 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PplQ9R269 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PplQ9R269 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PplQ9R269 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PplQ9R269 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PplQ9R269 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PplQ9R269 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PplQ9R269 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PplQ9R269 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PplQ9R269 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PplQ9R269 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PplQ9R269 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PplQ9R269 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PplQ9R269 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms