Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psma4Q9R1P0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psma4Q9R1P0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psma4Q9R1P0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Psma4Q9R1P0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psma4Q9R1P0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psma4Q9R1P0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psma4Q9R1P0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Psma4Q9R1P0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psma4Q9R1P0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psma4Q9R1P0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psma4Q9R1P0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psma4Q9R1P0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psma4Q9R1P0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psma4Q9R1P0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psma4Q9R1P0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psma4Q9R1P0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psma4Q9R1P0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psma4Q9R1P0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psma4Q9R1P0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psma4Q9R1P0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psma4Q9R1P0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psma4Q9R1P0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psma4Q9R1P0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psma4Q9R1P0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psma4Q9R1P0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psma4Q9R1P0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psma4Q9R1P0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psma4Q9R1P0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psma4Q9R1P0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psma4Q9R1P0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psma4Q9R1P0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psma4Q9R1P0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psma4Q9R1P0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psma4Q9R1P0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psma4Q9R1P0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psma4Q9R1P0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psma4Q9R1P0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psma4Q9R1P0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psma4Q9R1P0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psma4Q9R1P0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psma4Q9R1P0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psma4Q9R1P0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psma4Q9R1P0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psma4Q9R1P0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psma4Q9R1P0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psma4Q9R1P0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psma4Q9R1P0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Psma4Q9R1P0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psma4Q9R1P0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psma4Q9R1P0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psma4Q9R1P0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psma4Q9R1P0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psma4Q9R1P0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psma4Q9R1P0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psma4Q9R1P0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Psma4Q9R1P0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Psma4Q9R1P0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Psma4Q9R1P0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Psma4Q9R1P0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Psma4Q9R1P0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Psma4Q9R1P0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Psma4Q9R1P0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Psma4Q9R1P0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Psma4Q9R1P0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psma4Q9R1P0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psma4Q9R1P0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psma4Q9R1P0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psma4Q9R1P0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psma4Q9R1P0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psma4Q9R1P0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psma4Q9R1P0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psma4Q9R1P0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psma4Q9R1P0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psma4Q9R1P0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psma4Q9R1P0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psma4Q9R1P0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psma4Q9R1P0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psma4Q9R1P0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psma4Q9R1P0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psma4Q9R1P0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psma4Q9R1P0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psma4Q9R1P0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psma4Q9R1P0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psma4Q9R1P0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psma4Q9R1P0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psma4Q9R1P0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psma4Q9R1P0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psma4Q9R1P0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psma4Q9R1P0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psma4Q9R1P0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psma4Q9R1P0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psma4Q9R1P0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psma4Q9R1P0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psma4Q9R1P0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psma4Q9R1P0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psma4Q9R1P0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psma4Q9R1P0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psma4Q9R1P0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psma4Q9R1P0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms