Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A8

Rfwd2, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfwd2Q9R1A8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rfwd2Q9R1A8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rfwd2Q9R1A8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rfwd2Q9R1A8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rfwd2Q9R1A8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rfwd2Q9R1A8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rfwd2Q9R1A8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rfwd2Q9R1A8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rfwd2Q9R1A8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rfwd2Q9R1A8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rfwd2Q9R1A8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rfwd2Q9R1A8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rfwd2Q9R1A8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rfwd2Q9R1A8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rfwd2Q9R1A8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rfwd2Q9R1A8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rfwd2Q9R1A8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rfwd2Q9R1A8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rfwd2Q9R1A8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rfwd2Q9R1A8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rfwd2Q9R1A8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rfwd2Q9R1A8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rfwd2Q9R1A8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rfwd2Q9R1A8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rfwd2Q9R1A8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rfwd2Q9R1A8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rfwd2Q9R1A8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rfwd2Q9R1A8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rfwd2Q9R1A8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rfwd2Q9R1A8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rfwd2Q9R1A8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rfwd2Q9R1A8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rfwd2Q9R1A8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rfwd2Q9R1A8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rfwd2Q9R1A8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rfwd2Q9R1A8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rfwd2Q9R1A8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rfwd2Q9R1A8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rfwd2Q9R1A8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rfwd2Q9R1A8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rfwd2Q9R1A8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rfwd2Q9R1A8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rfwd2Q9R1A8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rfwd2Q9R1A8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rfwd2Q9R1A8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rfwd2Q9R1A8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rfwd2Q9R1A8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rfwd2Q9R1A8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rfwd2Q9R1A8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rfwd2Q9R1A8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rfwd2Q9R1A8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rfwd2Q9R1A8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rfwd2Q9R1A8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rfwd2Q9R1A8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rfwd2Q9R1A8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rfwd2Q9R1A8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rfwd2Q9R1A8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rfwd2Q9R1A8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rfwd2Q9R1A8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rfwd2Q9R1A8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rfwd2Q9R1A8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rfwd2Q9R1A8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rfwd2Q9R1A8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rfwd2Q9R1A8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rfwd2Q9R1A8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rfwd2Q9R1A8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rfwd2Q9R1A8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rfwd2Q9R1A8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rfwd2Q9R1A8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rfwd2Q9R1A8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rfwd2Q9R1A8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rfwd2Q9R1A8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rfwd2Q9R1A8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rfwd2Q9R1A8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rfwd2Q9R1A8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rfwd2Q9R1A8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rfwd2Q9R1A8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rfwd2Q9R1A8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rfwd2Q9R1A8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rfwd2Q9R1A8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rfwd2Q9R1A8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rfwd2Q9R1A8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rfwd2Q9R1A8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rfwd2Q9R1A8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rfwd2Q9R1A8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rfwd2Q9R1A8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rfwd2Q9R1A8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rfwd2Q9R1A8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rfwd2Q9R1A8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rfwd2Q9R1A8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rfwd2Q9R1A8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rfwd2Q9R1A8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rfwd2Q9R1A8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rfwd2Q9R1A8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rfwd2Q9R1A8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rfwd2Q9R1A8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rfwd2Q9R1A8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rfwd2Q9R1A8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rfwd2Q9R1A8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rfwd2Q9R1A8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms