Protein–RNA interactions for Protein: Q9R078

Prkab1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab1Q9R078 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prkab1Q9R078 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prkab1Q9R078 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prkab1Q9R078 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prkab1Q9R078 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prkab1Q9R078 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prkab1Q9R078 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prkab1Q9R078 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prkab1Q9R078 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prkab1Q9R078 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prkab1Q9R078 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prkab1Q9R078 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prkab1Q9R078 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prkab1Q9R078 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prkab1Q9R078 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Prkab1Q9R078 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Prkab1Q9R078 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prkab1Q9R078 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prkab1Q9R078 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prkab1Q9R078 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prkab1Q9R078 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prkab1Q9R078 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Prkab1Q9R078 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prkab1Q9R078 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prkab1Q9R078 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Prkab1Q9R078 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prkab1Q9R078 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prkab1Q9R078 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prkab1Q9R078 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prkab1Q9R078 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prkab1Q9R078 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prkab1Q9R078 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prkab1Q9R078 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prkab1Q9R078 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prkab1Q9R078 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prkab1Q9R078 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prkab1Q9R078 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prkab1Q9R078 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prkab1Q9R078 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prkab1Q9R078 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Prkab1Q9R078 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Prkab1Q9R078 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prkab1Q9R078 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prkab1Q9R078 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prkab1Q9R078 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prkab1Q9R078 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prkab1Q9R078 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prkab1Q9R078 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prkab1Q9R078 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prkab1Q9R078 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prkab1Q9R078 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prkab1Q9R078 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prkab1Q9R078 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prkab1Q9R078 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prkab1Q9R078 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prkab1Q9R078 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prkab1Q9R078 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prkab1Q9R078 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Prkab1Q9R078 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prkab1Q9R078 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prkab1Q9R078 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prkab1Q9R078 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prkab1Q9R078 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prkab1Q9R078 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prkab1Q9R078 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prkab1Q9R078 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prkab1Q9R078 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prkab1Q9R078 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prkab1Q9R078 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prkab1Q9R078 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prkab1Q9R078 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prkab1Q9R078 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prkab1Q9R078 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prkab1Q9R078 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prkab1Q9R078 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prkab1Q9R078 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Prkab1Q9R078 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prkab1Q9R078 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prkab1Q9R078 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prkab1Q9R078 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Prkab1Q9R078 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prkab1Q9R078 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prkab1Q9R078 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prkab1Q9R078 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prkab1Q9R078 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prkab1Q9R078 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prkab1Q9R078 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prkab1Q9R078 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Prkab1Q9R078 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prkab1Q9R078 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prkab1Q9R078 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prkab1Q9R078 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Prkab1Q9R078 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prkab1Q9R078 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Prkab1Q9R078 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prkab1Q9R078 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Prkab1Q9R078 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prkab1Q9R078 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prkab1Q9R078 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prkab1Q9R078 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms