Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYI8

Dnajb7, DnaJ homolog subfamily B member 7, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb7Q9QYI8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnajb7Q9QYI8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnajb7Q9QYI8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnajb7Q9QYI8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnajb7Q9QYI8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnajb7Q9QYI8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnajb7Q9QYI8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnajb7Q9QYI8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnajb7Q9QYI8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnajb7Q9QYI8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnajb7Q9QYI8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnajb7Q9QYI8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnajb7Q9QYI8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnajb7Q9QYI8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnajb7Q9QYI8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnajb7Q9QYI8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnajb7Q9QYI8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnajb7Q9QYI8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnajb7Q9QYI8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnajb7Q9QYI8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnajb7Q9QYI8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnajb7Q9QYI8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnajb7Q9QYI8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnajb7Q9QYI8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnajb7Q9QYI8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnajb7Q9QYI8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnajb7Q9QYI8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnajb7Q9QYI8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnajb7Q9QYI8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnajb7Q9QYI8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnajb7Q9QYI8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnajb7Q9QYI8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnajb7Q9QYI8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnajb7Q9QYI8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnajb7Q9QYI8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnajb7Q9QYI8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnajb7Q9QYI8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnajb7Q9QYI8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnajb7Q9QYI8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnajb7Q9QYI8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnajb7Q9QYI8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnajb7Q9QYI8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnajb7Q9QYI8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1
Dnajb7Q9QYI8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Dnajb7Q9QYI8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnajb7Q9QYI8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnajb7Q9QYI8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnajb7Q9QYI8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Dnajb7Q9QYI8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnajb7Q9QYI8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnajb7Q9QYI8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Dnajb7Q9QYI8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnajb7Q9QYI8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnajb7Q9QYI8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnajb7Q9QYI8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnajb7Q9QYI8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnajb7Q9QYI8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnajb7Q9QYI8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Dnajb7Q9QYI8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnajb7Q9QYI8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnajb7Q9QYI8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnajb7Q9QYI8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Dnajb7Q9QYI8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dnajb7Q9QYI8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dnajb7Q9QYI8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dnajb7Q9QYI8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dnajb7Q9QYI8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dnajb7Q9QYI8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnajb7Q9QYI8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Dnajb7Q9QYI8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnajb7Q9QYI8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnajb7Q9QYI8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnajb7Q9QYI8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnajb7Q9QYI8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnajb7Q9QYI8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnajb7Q9QYI8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Dnajb7Q9QYI8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Dnajb7Q9QYI8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Dnajb7Q9QYI8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnajb7Q9QYI8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnajb7Q9QYI8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajb7Q9QYI8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajb7Q9QYI8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Dnajb7Q9QYI8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajb7Q9QYI8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajb7Q9QYI8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajb7Q9QYI8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajb7Q9QYI8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajb7Q9QYI8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajb7Q9QYI8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajb7Q9QYI8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajb7Q9QYI8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajb7Q9QYI8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajb7Q9QYI8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajb7Q9QYI8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajb7Q9QYI8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajb7Q9QYI8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dnajb7Q9QYI8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dnajb7Q9QYI8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dnajb7Q9QYI8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms