Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY39

Pdzd4, PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd4Q9QY39 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdzd4Q9QY39 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdzd4Q9QY39 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdzd4Q9QY39 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdzd4Q9QY39 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdzd4Q9QY39 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdzd4Q9QY39 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdzd4Q9QY39 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdzd4Q9QY39 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdzd4Q9QY39 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdzd4Q9QY39 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdzd4Q9QY39 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdzd4Q9QY39 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdzd4Q9QY39 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdzd4Q9QY39 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdzd4Q9QY39 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdzd4Q9QY39 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdzd4Q9QY39 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdzd4Q9QY39 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdzd4Q9QY39 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdzd4Q9QY39 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdzd4Q9QY39 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdzd4Q9QY39 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdzd4Q9QY39 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdzd4Q9QY39 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdzd4Q9QY39 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdzd4Q9QY39 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdzd4Q9QY39 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdzd4Q9QY39 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdzd4Q9QY39 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdzd4Q9QY39 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdzd4Q9QY39 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdzd4Q9QY39 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdzd4Q9QY39 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdzd4Q9QY39 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdzd4Q9QY39 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdzd4Q9QY39 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdzd4Q9QY39 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdzd4Q9QY39 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdzd4Q9QY39 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdzd4Q9QY39 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdzd4Q9QY39 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdzd4Q9QY39 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdzd4Q9QY39 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdzd4Q9QY39 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdzd4Q9QY39 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdzd4Q9QY39 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdzd4Q9QY39 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdzd4Q9QY39 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdzd4Q9QY39 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdzd4Q9QY39 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdzd4Q9QY39 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdzd4Q9QY39 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdzd4Q9QY39 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdzd4Q9QY39 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdzd4Q9QY39 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pdzd4Q9QY39 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pdzd4Q9QY39 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pdzd4Q9QY39 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pdzd4Q9QY39 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pdzd4Q9QY39 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pdzd4Q9QY39 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pdzd4Q9QY39 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdzd4Q9QY39 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdzd4Q9QY39 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdzd4Q9QY39 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdzd4Q9QY39 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdzd4Q9QY39 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdzd4Q9QY39 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdzd4Q9QY39 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdzd4Q9QY39 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdzd4Q9QY39 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdzd4Q9QY39 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdzd4Q9QY39 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdzd4Q9QY39 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdzd4Q9QY39 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdzd4Q9QY39 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdzd4Q9QY39 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdzd4Q9QY39 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdzd4Q9QY39 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdzd4Q9QY39 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdzd4Q9QY39 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdzd4Q9QY39 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdzd4Q9QY39 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdzd4Q9QY39 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdzd4Q9QY39 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdzd4Q9QY39 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdzd4Q9QY39 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdzd4Q9QY39 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdzd4Q9QY39 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdzd4Q9QY39 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdzd4Q9QY39 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdzd4Q9QY39 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdzd4Q9QY39 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdzd4Q9QY39 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdzd4Q9QY39 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdzd4Q9QY39 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdzd4Q9QY39 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdzd4Q9QY39 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pdzd4Q9QY39 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms