Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ChmQ9QXG2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ChmQ9QXG2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ChmQ9QXG2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ChmQ9QXG2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ChmQ9QXG2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ChmQ9QXG2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ChmQ9QXG2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ChmQ9QXG2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ChmQ9QXG2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ChmQ9QXG2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ChmQ9QXG2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ChmQ9QXG2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ChmQ9QXG2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ChmQ9QXG2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ChmQ9QXG2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ChmQ9QXG2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ChmQ9QXG2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ChmQ9QXG2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ChmQ9QXG2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ChmQ9QXG2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ChmQ9QXG2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ChmQ9QXG2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ChmQ9QXG2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ChmQ9QXG2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ChmQ9QXG2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ChmQ9QXG2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ChmQ9QXG2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ChmQ9QXG2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ChmQ9QXG2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ChmQ9QXG2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ChmQ9QXG2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ChmQ9QXG2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ChmQ9QXG2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ChmQ9QXG2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ChmQ9QXG2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ChmQ9QXG2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ChmQ9QXG2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ChmQ9QXG2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ChmQ9QXG2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ChmQ9QXG2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ChmQ9QXG2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ChmQ9QXG2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ChmQ9QXG2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ChmQ9QXG2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ChmQ9QXG2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ChmQ9QXG2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ChmQ9QXG2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ChmQ9QXG2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ChmQ9QXG2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ChmQ9QXG2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ChmQ9QXG2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ChmQ9QXG2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ChmQ9QXG2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ChmQ9QXG2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ChmQ9QXG2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ChmQ9QXG2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ChmQ9QXG2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ChmQ9QXG2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ChmQ9QXG2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ChmQ9QXG2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ChmQ9QXG2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ChmQ9QXG2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ChmQ9QXG2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ChmQ9QXG2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ChmQ9QXG2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ChmQ9QXG2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ChmQ9QXG2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ChmQ9QXG2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ChmQ9QXG2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ChmQ9QXG2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ChmQ9QXG2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ChmQ9QXG2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ChmQ9QXG2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ChmQ9QXG2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ChmQ9QXG2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ChmQ9QXG2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ChmQ9QXG2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ChmQ9QXG2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ChmQ9QXG2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ChmQ9QXG2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ChmQ9QXG2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ChmQ9QXG2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ChmQ9QXG2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ChmQ9QXG2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ChmQ9QXG2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ChmQ9QXG2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ChmQ9QXG2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ChmQ9QXG2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ChmQ9QXG2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ChmQ9QXG2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ChmQ9QXG2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ChmQ9QXG2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ChmQ9QXG2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ChmQ9QXG2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ChmQ9QXG2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ChmQ9QXG2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ChmQ9QXG2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ChmQ9QXG2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ChmQ9QXG2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms