Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim44Q9QXA7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim44Q9QXA7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim44Q9QXA7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim44Q9QXA7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim44Q9QXA7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim44Q9QXA7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim44Q9QXA7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim44Q9QXA7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim44Q9QXA7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim44Q9QXA7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim44Q9QXA7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim44Q9QXA7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim44Q9QXA7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim44Q9QXA7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim44Q9QXA7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim44Q9QXA7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim44Q9QXA7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim44Q9QXA7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim44Q9QXA7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim44Q9QXA7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim44Q9QXA7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim44Q9QXA7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim44Q9QXA7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim44Q9QXA7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim44Q9QXA7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim44Q9QXA7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim44Q9QXA7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim44Q9QXA7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim44Q9QXA7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim44Q9QXA7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim44Q9QXA7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim44Q9QXA7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim44Q9QXA7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim44Q9QXA7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim44Q9QXA7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim44Q9QXA7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim44Q9QXA7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim44Q9QXA7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim44Q9QXA7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim44Q9QXA7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim44Q9QXA7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim44Q9QXA7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim44Q9QXA7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim44Q9QXA7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim44Q9QXA7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim44Q9QXA7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim44Q9QXA7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim44Q9QXA7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim44Q9QXA7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim44Q9QXA7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim44Q9QXA7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim44Q9QXA7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim44Q9QXA7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim44Q9QXA7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim44Q9QXA7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim44Q9QXA7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trim44Q9QXA7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trim44Q9QXA7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trim44Q9QXA7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trim44Q9QXA7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim44Q9QXA7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms