Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUG2

Polk, DNA polymerase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolkQ9QUG2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PolkQ9QUG2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PolkQ9QUG2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PolkQ9QUG2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PolkQ9QUG2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PolkQ9QUG2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PolkQ9QUG2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PolkQ9QUG2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PolkQ9QUG2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PolkQ9QUG2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PolkQ9QUG2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PolkQ9QUG2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PolkQ9QUG2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PolkQ9QUG2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PolkQ9QUG2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PolkQ9QUG2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PolkQ9QUG2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PolkQ9QUG2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PolkQ9QUG2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PolkQ9QUG2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PolkQ9QUG2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PolkQ9QUG2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PolkQ9QUG2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PolkQ9QUG2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PolkQ9QUG2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PolkQ9QUG2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PolkQ9QUG2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PolkQ9QUG2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PolkQ9QUG2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PolkQ9QUG2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PolkQ9QUG2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PolkQ9QUG2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PolkQ9QUG2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PolkQ9QUG2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PolkQ9QUG2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PolkQ9QUG2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PolkQ9QUG2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PolkQ9QUG2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PolkQ9QUG2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PolkQ9QUG2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PolkQ9QUG2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PolkQ9QUG2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PolkQ9QUG2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PolkQ9QUG2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PolkQ9QUG2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PolkQ9QUG2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PolkQ9QUG2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PolkQ9QUG2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PolkQ9QUG2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PolkQ9QUG2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PolkQ9QUG2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PolkQ9QUG2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PolkQ9QUG2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PolkQ9QUG2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PolkQ9QUG2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PolkQ9QUG2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PolkQ9QUG2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PolkQ9QUG2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PolkQ9QUG2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PolkQ9QUG2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PolkQ9QUG2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PolkQ9QUG2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PolkQ9QUG2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PolkQ9QUG2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PolkQ9QUG2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PolkQ9QUG2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PolkQ9QUG2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PolkQ9QUG2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PolkQ9QUG2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PolkQ9QUG2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PolkQ9QUG2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PolkQ9QUG2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PolkQ9QUG2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PolkQ9QUG2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PolkQ9QUG2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PolkQ9QUG2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PolkQ9QUG2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PolkQ9QUG2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PolkQ9QUG2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PolkQ9QUG2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PolkQ9QUG2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PolkQ9QUG2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PolkQ9QUG2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PolkQ9QUG2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PolkQ9QUG2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PolkQ9QUG2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PolkQ9QUG2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PolkQ9QUG2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PolkQ9QUG2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PolkQ9QUG2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PolkQ9QUG2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PolkQ9QUG2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PolkQ9QUG2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PolkQ9QUG2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PolkQ9QUG2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PolkQ9QUG2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PolkQ9QUG2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PolkQ9QUG2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PolkQ9QUG2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PolkQ9QUG2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.8 ms