Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME9

Vstm2b, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2bQ9JME9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vstm2bQ9JME9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vstm2bQ9JME9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vstm2bQ9JME9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vstm2bQ9JME9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vstm2bQ9JME9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Vstm2bQ9JME9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Vstm2bQ9JME9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vstm2bQ9JME9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vstm2bQ9JME9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vstm2bQ9JME9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vstm2bQ9JME9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vstm2bQ9JME9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vstm2bQ9JME9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vstm2bQ9JME9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vstm2bQ9JME9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vstm2bQ9JME9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vstm2bQ9JME9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vstm2bQ9JME9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Vstm2bQ9JME9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vstm2bQ9JME9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vstm2bQ9JME9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vstm2bQ9JME9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vstm2bQ9JME9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vstm2bQ9JME9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vstm2bQ9JME9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vstm2bQ9JME9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vstm2bQ9JME9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vstm2bQ9JME9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vstm2bQ9JME9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vstm2bQ9JME9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vstm2bQ9JME9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Vstm2bQ9JME9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vstm2bQ9JME9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vstm2bQ9JME9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vstm2bQ9JME9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vstm2bQ9JME9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vstm2bQ9JME9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vstm2bQ9JME9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vstm2bQ9JME9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Vstm2bQ9JME9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vstm2bQ9JME9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vstm2bQ9JME9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vstm2bQ9JME9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vstm2bQ9JME9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vstm2bQ9JME9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vstm2bQ9JME9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vstm2bQ9JME9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vstm2bQ9JME9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vstm2bQ9JME9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vstm2bQ9JME9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vstm2bQ9JME9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vstm2bQ9JME9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vstm2bQ9JME9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vstm2bQ9JME9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vstm2bQ9JME9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vstm2bQ9JME9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vstm2bQ9JME9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vstm2bQ9JME9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vstm2bQ9JME9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vstm2bQ9JME9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vstm2bQ9JME9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vstm2bQ9JME9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vstm2bQ9JME9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vstm2bQ9JME9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vstm2bQ9JME9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Vstm2bQ9JME9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Vstm2bQ9JME9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vstm2bQ9JME9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vstm2bQ9JME9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vstm2bQ9JME9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vstm2bQ9JME9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vstm2bQ9JME9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vstm2bQ9JME9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vstm2bQ9JME9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vstm2bQ9JME9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vstm2bQ9JME9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vstm2bQ9JME9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vstm2bQ9JME9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vstm2bQ9JME9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vstm2bQ9JME9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vstm2bQ9JME9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vstm2bQ9JME9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vstm2bQ9JME9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vstm2bQ9JME9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vstm2bQ9JME9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vstm2bQ9JME9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vstm2bQ9JME9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vstm2bQ9JME9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vstm2bQ9JME9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Vstm2bQ9JME9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vstm2bQ9JME9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vstm2bQ9JME9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Vstm2bQ9JME9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vstm2bQ9JME9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vstm2bQ9JME9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vstm2bQ9JME9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vstm2bQ9JME9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vstm2bQ9JME9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vstm2bQ9JME9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms