Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM96

Cdc42ep4, Cdc42 effector protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep4Q9JM96 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdc42ep4Q9JM96 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdc42ep4Q9JM96 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdc42ep4Q9JM96 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdc42ep4Q9JM96 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdc42ep4Q9JM96 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdc42ep4Q9JM96 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdc42ep4Q9JM96 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdc42ep4Q9JM96 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdc42ep4Q9JM96 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdc42ep4Q9JM96 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdc42ep4Q9JM96 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdc42ep4Q9JM96 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cdc42ep4Q9JM96 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cdc42ep4Q9JM96 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdc42ep4Q9JM96 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdc42ep4Q9JM96 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdc42ep4Q9JM96 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdc42ep4Q9JM96 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdc42ep4Q9JM96 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdc42ep4Q9JM96 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdc42ep4Q9JM96 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdc42ep4Q9JM96 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdc42ep4Q9JM96 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdc42ep4Q9JM96 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdc42ep4Q9JM96 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdc42ep4Q9JM96 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdc42ep4Q9JM96 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdc42ep4Q9JM96 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdc42ep4Q9JM96 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdc42ep4Q9JM96 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdc42ep4Q9JM96 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdc42ep4Q9JM96 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdc42ep4Q9JM96 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdc42ep4Q9JM96 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdc42ep4Q9JM96 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdc42ep4Q9JM96 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdc42ep4Q9JM96 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdc42ep4Q9JM96 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdc42ep4Q9JM96 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdc42ep4Q9JM96 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdc42ep4Q9JM96 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdc42ep4Q9JM96 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdc42ep4Q9JM96 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdc42ep4Q9JM96 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdc42ep4Q9JM96 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdc42ep4Q9JM96 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdc42ep4Q9JM96 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdc42ep4Q9JM96 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdc42ep4Q9JM96 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdc42ep4Q9JM96 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdc42ep4Q9JM96 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdc42ep4Q9JM96 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdc42ep4Q9JM96 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdc42ep4Q9JM96 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdc42ep4Q9JM96 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdc42ep4Q9JM96 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdc42ep4Q9JM96 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdc42ep4Q9JM96 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdc42ep4Q9JM96 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdc42ep4Q9JM96 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdc42ep4Q9JM96 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdc42ep4Q9JM96 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdc42ep4Q9JM96 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdc42ep4Q9JM96 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdc42ep4Q9JM96 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdc42ep4Q9JM96 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdc42ep4Q9JM96 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdc42ep4Q9JM96 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdc42ep4Q9JM96 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdc42ep4Q9JM96 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdc42ep4Q9JM96 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdc42ep4Q9JM96 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdc42ep4Q9JM96 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdc42ep4Q9JM96 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdc42ep4Q9JM96 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdc42ep4Q9JM96 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdc42ep4Q9JM96 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdc42ep4Q9JM96 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdc42ep4Q9JM96 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdc42ep4Q9JM96 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdc42ep4Q9JM96 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdc42ep4Q9JM96 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdc42ep4Q9JM96 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdc42ep4Q9JM96 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdc42ep4Q9JM96 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdc42ep4Q9JM96 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdc42ep4Q9JM96 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdc42ep4Q9JM96 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdc42ep4Q9JM96 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdc42ep4Q9JM96 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdc42ep4Q9JM96 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdc42ep4Q9JM96 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdc42ep4Q9JM96 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdc42ep4Q9JM96 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdc42ep4Q9JM96 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdc42ep4Q9JM96 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdc42ep4Q9JM96 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdc42ep4Q9JM96 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms