Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SrfQ9JM73 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SrfQ9JM73 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SrfQ9JM73 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SrfQ9JM73 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SrfQ9JM73 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SrfQ9JM73 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SrfQ9JM73 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SrfQ9JM73 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SrfQ9JM73 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SrfQ9JM73 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SrfQ9JM73 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SrfQ9JM73 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SrfQ9JM73 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SrfQ9JM73 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SrfQ9JM73 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SrfQ9JM73 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SrfQ9JM73 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SrfQ9JM73 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SrfQ9JM73 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SrfQ9JM73 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SrfQ9JM73 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SrfQ9JM73 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SrfQ9JM73 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SrfQ9JM73 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SrfQ9JM73 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SrfQ9JM73 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SrfQ9JM73 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SrfQ9JM73 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SrfQ9JM73 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SrfQ9JM73 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SrfQ9JM73 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SrfQ9JM73 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SrfQ9JM73 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrfQ9JM73 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrfQ9JM73 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrfQ9JM73 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SrfQ9JM73 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrfQ9JM73 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrfQ9JM73 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrfQ9JM73 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrfQ9JM73 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrfQ9JM73 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SrfQ9JM73 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SrfQ9JM73 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SrfQ9JM73 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SrfQ9JM73 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SrfQ9JM73 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SrfQ9JM73 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SrfQ9JM73 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SrfQ9JM73 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SrfQ9JM73 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SrfQ9JM73 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SrfQ9JM73 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SrfQ9JM73 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SrfQ9JM73 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SrfQ9JM73 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SrfQ9JM73 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SrfQ9JM73 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SrfQ9JM73 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SrfQ9JM73 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SrfQ9JM73 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SrfQ9JM73 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SrfQ9JM73 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SrfQ9JM73 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SrfQ9JM73 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SrfQ9JM73 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SrfQ9JM73 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SrfQ9JM73 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SrfQ9JM73 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SrfQ9JM73 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SrfQ9JM73 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SrfQ9JM73 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SrfQ9JM73 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SrfQ9JM73 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SrfQ9JM73 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SrfQ9JM73 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SrfQ9JM73 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SrfQ9JM73 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SrfQ9JM73 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SrfQ9JM73 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SrfQ9JM73 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SrfQ9JM73 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SrfQ9JM73 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SrfQ9JM73 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrfQ9JM73 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrfQ9JM73 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrfQ9JM73 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrfQ9JM73 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrfQ9JM73 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrfQ9JM73 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrfQ9JM73 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SrfQ9JM73 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrfQ9JM73 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SrfQ9JM73 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrfQ9JM73 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrfQ9JM73 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrfQ9JM73 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrfQ9JM73 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrfQ9JM73 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms