Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ0

Litaf, Lipopolysaccharide-induced tumor necrosis factor-alpha factor homolog, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LitafQ9JLJ0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LitafQ9JLJ0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LitafQ9JLJ0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LitafQ9JLJ0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LitafQ9JLJ0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LitafQ9JLJ0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LitafQ9JLJ0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LitafQ9JLJ0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LitafQ9JLJ0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LitafQ9JLJ0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LitafQ9JLJ0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LitafQ9JLJ0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LitafQ9JLJ0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LitafQ9JLJ0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LitafQ9JLJ0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LitafQ9JLJ0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LitafQ9JLJ0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LitafQ9JLJ0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LitafQ9JLJ0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LitafQ9JLJ0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LitafQ9JLJ0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LitafQ9JLJ0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LitafQ9JLJ0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LitafQ9JLJ0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LitafQ9JLJ0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LitafQ9JLJ0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
LitafQ9JLJ0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LitafQ9JLJ0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms