Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL95

Prg3, Proteoglycan 3, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg3Q9JL95 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prg3Q9JL95 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prg3Q9JL95 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prg3Q9JL95 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prg3Q9JL95 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prg3Q9JL95 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prg3Q9JL95 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prg3Q9JL95 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prg3Q9JL95 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prg3Q9JL95 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prg3Q9JL95 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prg3Q9JL95 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prg3Q9JL95 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prg3Q9JL95 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prg3Q9JL95 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prg3Q9JL95 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prg3Q9JL95 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prg3Q9JL95 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prg3Q9JL95 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prg3Q9JL95 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prg3Q9JL95 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prg3Q9JL95 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prg3Q9JL95 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prg3Q9JL95 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prg3Q9JL95 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prg3Q9JL95 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prg3Q9JL95 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prg3Q9JL95 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prg3Q9JL95 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Prg3Q9JL95 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prg3Q9JL95 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prg3Q9JL95 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prg3Q9JL95 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prg3Q9JL95 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prg3Q9JL95 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Prg3Q9JL95 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Prg3Q9JL95 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prg3Q9JL95 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prg3Q9JL95 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prg3Q9JL95 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prg3Q9JL95 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prg3Q9JL95 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prg3Q9JL95 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prg3Q9JL95 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Prg3Q9JL95 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prg3Q9JL95 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prg3Q9JL95 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prg3Q9JL95 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prg3Q9JL95 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prg3Q9JL95 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prg3Q9JL95 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prg3Q9JL95 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prg3Q9JL95 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Prg3Q9JL95 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prg3Q9JL95 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prg3Q9JL95 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prg3Q9JL95 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prg3Q9JL95 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prg3Q9JL95 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prg3Q9JL95 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prg3Q9JL95 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prg3Q9JL95 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prg3Q9JL95 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Prg3Q9JL95 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prg3Q9JL95 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prg3Q9JL95 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prg3Q9JL95 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prg3Q9JL95 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prg3Q9JL95 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prg3Q9JL95 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prg3Q9JL95 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prg3Q9JL95 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prg3Q9JL95 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prg3Q9JL95 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prg3Q9JL95 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Prg3Q9JL95 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prg3Q9JL95 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prg3Q9JL95 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prg3Q9JL95 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prg3Q9JL95 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prg3Q9JL95 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prg3Q9JL95 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prg3Q9JL95 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prg3Q9JL95 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prg3Q9JL95 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prg3Q9JL95 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prg3Q9JL95 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prg3Q9JL95 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prg3Q9JL95 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prg3Q9JL95 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prg3Q9JL95 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prg3Q9JL95 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Prg3Q9JL95 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prg3Q9JL95 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prg3Q9JL95 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Prg3Q9JL95 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prg3Q9JL95 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prg3Q9JL95 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prg3Q9JL95 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prg3Q9JL95 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms