Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL19

Ncoa6, Nuclear receptor coactivator 6, mousemouse

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Length 2,067 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncoa6Q9JL19 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ncoa6Q9JL19 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ncoa6Q9JL19 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ncoa6Q9JL19 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ncoa6Q9JL19 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ncoa6Q9JL19 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ncoa6Q9JL19 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ncoa6Q9JL19 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ncoa6Q9JL19 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ncoa6Q9JL19 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ncoa6Q9JL19 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ncoa6Q9JL19 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ncoa6Q9JL19 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ncoa6Q9JL19 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ncoa6Q9JL19 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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Ncoa6Q9JL19 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ncoa6Q9JL19 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ncoa6Q9JL19 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ncoa6Q9JL19 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ncoa6Q9JL19 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ncoa6Q9JL19 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ncoa6Q9JL19 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ncoa6Q9JL19 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ncoa6Q9JL19 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
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Ncoa6Q9JL19 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ncoa6Q9JL19 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ncoa6Q9JL19 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ncoa6Q9JL19 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ncoa6Q9JL19 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ncoa6Q9JL19 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Ncoa6Q9JL19 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Ncoa6Q9JL19 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Ncoa6Q9JL19 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ncoa6Q9JL19 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Ncoa6Q9JL19 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Ncoa6Q9JL19 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ncoa6Q9JL19 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Ncoa6Q9JL19 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ncoa6Q9JL19 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ncoa6Q9JL19 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ncoa6Q9JL19 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ncoa6Q9JL19 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ncoa6Q9JL19 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ncoa6Q9JL19 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ncoa6Q9JL19 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ncoa6Q9JL19 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ncoa6Q9JL19 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ncoa6Q9JL19 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ncoa6Q9JL19 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ncoa6Q9JL19 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ncoa6Q9JL19 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ncoa6Q9JL19 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ncoa6Q9JL19 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ncoa6Q9JL19 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ncoa6Q9JL19 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms