Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKW0

Arl6ip1, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6ip1Q9JKW0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arl6ip1Q9JKW0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arl6ip1Q9JKW0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Arl6ip1Q9JKW0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arl6ip1Q9JKW0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Arl6ip1Q9JKW0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Arl6ip1Q9JKW0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arl6ip1Q9JKW0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arl6ip1Q9JKW0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arl6ip1Q9JKW0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arl6ip1Q9JKW0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arl6ip1Q9JKW0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arl6ip1Q9JKW0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arl6ip1Q9JKW0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arl6ip1Q9JKW0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arl6ip1Q9JKW0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arl6ip1Q9JKW0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arl6ip1Q9JKW0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arl6ip1Q9JKW0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arl6ip1Q9JKW0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arl6ip1Q9JKW0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arl6ip1Q9JKW0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arl6ip1Q9JKW0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arl6ip1Q9JKW0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arl6ip1Q9JKW0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Arl6ip1Q9JKW0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arl6ip1Q9JKW0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arl6ip1Q9JKW0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arl6ip1Q9JKW0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arl6ip1Q9JKW0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arl6ip1Q9JKW0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arl6ip1Q9JKW0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arl6ip1Q9JKW0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arl6ip1Q9JKW0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arl6ip1Q9JKW0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arl6ip1Q9JKW0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arl6ip1Q9JKW0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arl6ip1Q9JKW0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arl6ip1Q9JKW0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arl6ip1Q9JKW0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arl6ip1Q9JKW0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arl6ip1Q9JKW0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arl6ip1Q9JKW0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arl6ip1Q9JKW0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Arl6ip1Q9JKW0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arl6ip1Q9JKW0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arl6ip1Q9JKW0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arl6ip1Q9JKW0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arl6ip1Q9JKW0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arl6ip1Q9JKW0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arl6ip1Q9JKW0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arl6ip1Q9JKW0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arl6ip1Q9JKW0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arl6ip1Q9JKW0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arl6ip1Q9JKW0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arl6ip1Q9JKW0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arl6ip1Q9JKW0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arl6ip1Q9JKW0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arl6ip1Q9JKW0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arl6ip1Q9JKW0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arl6ip1Q9JKW0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arl6ip1Q9JKW0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arl6ip1Q9JKW0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Arl6ip1Q9JKW0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arl6ip1Q9JKW0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arl6ip1Q9JKW0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arl6ip1Q9JKW0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arl6ip1Q9JKW0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arl6ip1Q9JKW0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms