Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Irx5Q9JKQ4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Irx5Q9JKQ4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Irx5Q9JKQ4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Irx5Q9JKQ4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Irx5Q9JKQ4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Irx5Q9JKQ4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Irx5Q9JKQ4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Irx5Q9JKQ4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Irx5Q9JKQ4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Irx5Q9JKQ4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Irx5Q9JKQ4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Irx5Q9JKQ4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Irx5Q9JKQ4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Irx5Q9JKQ4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Irx5Q9JKQ4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Irx5Q9JKQ4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Irx5Q9JKQ4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Irx5Q9JKQ4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Irx5Q9JKQ4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Irx5Q9JKQ4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Irx5Q9JKQ4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Irx5Q9JKQ4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Irx5Q9JKQ4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Irx5Q9JKQ4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Irx5Q9JKQ4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Irx5Q9JKQ4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Irx5Q9JKQ4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Irx5Q9JKQ4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Irx5Q9JKQ4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Irx5Q9JKQ4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Irx5Q9JKQ4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Irx5Q9JKQ4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Irx5Q9JKQ4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Irx5Q9JKQ4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Irx5Q9JKQ4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Irx5Q9JKQ4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Irx5Q9JKQ4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Irx5Q9JKQ4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Irx5Q9JKQ4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Irx5Q9JKQ4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Irx5Q9JKQ4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Irx5Q9JKQ4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Irx5Q9JKQ4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Irx5Q9JKQ4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Irx5Q9JKQ4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irx5Q9JKQ4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irx5Q9JKQ4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irx5Q9JKQ4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irx5Q9JKQ4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irx5Q9JKQ4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irx5Q9JKQ4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Irx5Q9JKQ4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irx5Q9JKQ4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irx5Q9JKQ4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irx5Q9JKQ4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irx5Q9JKQ4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Irx5Q9JKQ4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irx5Q9JKQ4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irx5Q9JKQ4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irx5Q9JKQ4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irx5Q9JKQ4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Irx5Q9JKQ4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irx5Q9JKQ4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irx5Q9JKQ4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irx5Q9JKQ4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irx5Q9JKQ4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irx5Q9JKQ4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irx5Q9JKQ4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Irx5Q9JKQ4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irx5Q9JKQ4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irx5Q9JKQ4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irx5Q9JKQ4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irx5Q9JKQ4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irx5Q9JKQ4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irx5Q9JKQ4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Irx5Q9JKQ4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irx5Q9JKQ4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irx5Q9JKQ4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irx5Q9JKQ4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irx5Q9JKQ4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irx5Q9JKQ4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irx5Q9JKQ4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irx5Q9JKQ4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irx5Q9JKQ4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Irx5Q9JKQ4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irx5Q9JKQ4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irx5Q9JKQ4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irx5Q9JKQ4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irx5Q9JKQ4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irx5Q9JKQ4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irx5Q9JKQ4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irx5Q9JKQ4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Irx5Q9JKQ4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Irx5Q9JKQ4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Irx5Q9JKQ4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Irx5Q9JKQ4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Irx5Q9JKQ4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Irx5Q9JKQ4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Irx5Q9JKQ4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms