Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR7

Ascl3, Achaete-scute homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl3Q9JJR7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ascl3Q9JJR7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ascl3Q9JJR7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ascl3Q9JJR7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ascl3Q9JJR7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ascl3Q9JJR7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ascl3Q9JJR7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ascl3Q9JJR7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ascl3Q9JJR7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ascl3Q9JJR7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ascl3Q9JJR7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ascl3Q9JJR7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ascl3Q9JJR7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ascl3Q9JJR7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ascl3Q9JJR7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ascl3Q9JJR7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ascl3Q9JJR7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ascl3Q9JJR7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ascl3Q9JJR7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ascl3Q9JJR7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ascl3Q9JJR7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ascl3Q9JJR7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ascl3Q9JJR7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ascl3Q9JJR7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ascl3Q9JJR7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Ascl3Q9JJR7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ascl3Q9JJR7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ascl3Q9JJR7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ascl3Q9JJR7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ascl3Q9JJR7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ascl3Q9JJR7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ascl3Q9JJR7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ascl3Q9JJR7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ascl3Q9JJR7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ascl3Q9JJR7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ascl3Q9JJR7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ascl3Q9JJR7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ascl3Q9JJR7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ascl3Q9JJR7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ascl3Q9JJR7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ascl3Q9JJR7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ascl3Q9JJR7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ascl3Q9JJR7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ascl3Q9JJR7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ascl3Q9JJR7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ascl3Q9JJR7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ascl3Q9JJR7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ascl3Q9JJR7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Ascl3Q9JJR7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ascl3Q9JJR7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ascl3Q9JJR7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ascl3Q9JJR7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ascl3Q9JJR7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ascl3Q9JJR7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ascl3Q9JJR7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ascl3Q9JJR7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ascl3Q9JJR7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ascl3Q9JJR7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ascl3Q9JJR7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ascl3Q9JJR7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ascl3Q9JJR7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ascl3Q9JJR7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ascl3Q9JJR7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ascl3Q9JJR7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ascl3Q9JJR7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ascl3Q9JJR7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ascl3Q9JJR7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ascl3Q9JJR7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ascl3Q9JJR7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ascl3Q9JJR7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ascl3Q9JJR7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ascl3Q9JJR7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ascl3Q9JJR7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ascl3Q9JJR7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ascl3Q9JJR7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ascl3Q9JJR7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ascl3Q9JJR7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ascl3Q9JJR7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ascl3Q9JJR7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ascl3Q9JJR7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ascl3Q9JJR7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ascl3Q9JJR7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ascl3Q9JJR7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ascl3Q9JJR7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ascl3Q9JJR7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ascl3Q9JJR7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ascl3Q9JJR7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ascl3Q9JJR7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ascl3Q9JJR7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ascl3Q9JJR7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ascl3Q9JJR7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ascl3Q9JJR7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ascl3Q9JJR7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ascl3Q9JJR7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ascl3Q9JJR7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ascl3Q9JJR7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ascl3Q9JJR7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ascl3Q9JJR7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ascl3Q9JJR7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ascl3Q9JJR7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms