Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIZ0

Cml1, Probable N-acetyltransferase CML1, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cml1Q9JIZ0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cml1Q9JIZ0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cml1Q9JIZ0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cml1Q9JIZ0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cml1Q9JIZ0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cml1Q9JIZ0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cml1Q9JIZ0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cml1Q9JIZ0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cml1Q9JIZ0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cml1Q9JIZ0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cml1Q9JIZ0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cml1Q9JIZ0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cml1Q9JIZ0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cml1Q9JIZ0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cml1Q9JIZ0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cml1Q9JIZ0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cml1Q9JIZ0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cml1Q9JIZ0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cml1Q9JIZ0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cml1Q9JIZ0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cml1Q9JIZ0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cml1Q9JIZ0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cml1Q9JIZ0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cml1Q9JIZ0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cml1Q9JIZ0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cml1Q9JIZ0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cml1Q9JIZ0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cml1Q9JIZ0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cml1Q9JIZ0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cml1Q9JIZ0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cml1Q9JIZ0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cml1Q9JIZ0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cml1Q9JIZ0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cml1Q9JIZ0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cml1Q9JIZ0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cml1Q9JIZ0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cml1Q9JIZ0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cml1Q9JIZ0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cml1Q9JIZ0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cml1Q9JIZ0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cml1Q9JIZ0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cml1Q9JIZ0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cml1Q9JIZ0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cml1Q9JIZ0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cml1Q9JIZ0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cml1Q9JIZ0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cml1Q9JIZ0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cml1Q9JIZ0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cml1Q9JIZ0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cml1Q9JIZ0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cml1Q9JIZ0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cml1Q9JIZ0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cml1Q9JIZ0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cml1Q9JIZ0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cml1Q9JIZ0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cml1Q9JIZ0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cml1Q9JIZ0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cml1Q9JIZ0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cml1Q9JIZ0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cml1Q9JIZ0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cml1Q9JIZ0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cml1Q9JIZ0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cml1Q9JIZ0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cml1Q9JIZ0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cml1Q9JIZ0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cml1Q9JIZ0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cml1Q9JIZ0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cml1Q9JIZ0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cml1Q9JIZ0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cml1Q9JIZ0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cml1Q9JIZ0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cml1Q9JIZ0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cml1Q9JIZ0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cml1Q9JIZ0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cml1Q9JIZ0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cml1Q9JIZ0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cml1Q9JIZ0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cml1Q9JIZ0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cml1Q9JIZ0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cml1Q9JIZ0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cml1Q9JIZ0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cml1Q9JIZ0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cml1Q9JIZ0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cml1Q9JIZ0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cml1Q9JIZ0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cml1Q9JIZ0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cml1Q9JIZ0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cml1Q9JIZ0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cml1Q9JIZ0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cml1Q9JIZ0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cml1Q9JIZ0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cml1Q9JIZ0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cml1Q9JIZ0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cml1Q9JIZ0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cml1Q9JIZ0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cml1Q9JIZ0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cml1Q9JIZ0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cml1Q9JIZ0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cml1Q9JIZ0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cml1Q9JIZ0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms