Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIF0

Prmt1, Protein arginine N-methyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prmt1Q9JIF0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Prmt1Q9JIF0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prmt1Q9JIF0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prmt1Q9JIF0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prmt1Q9JIF0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prmt1Q9JIF0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prmt1Q9JIF0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prmt1Q9JIF0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prmt1Q9JIF0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prmt1Q9JIF0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prmt1Q9JIF0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prmt1Q9JIF0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prmt1Q9JIF0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prmt1Q9JIF0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prmt1Q9JIF0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prmt1Q9JIF0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prmt1Q9JIF0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prmt1Q9JIF0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Prmt1Q9JIF0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prmt1Q9JIF0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prmt1Q9JIF0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prmt1Q9JIF0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prmt1Q9JIF0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prmt1Q9JIF0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prmt1Q9JIF0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prmt1Q9JIF0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prmt1Q9JIF0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prmt1Q9JIF0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prmt1Q9JIF0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prmt1Q9JIF0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prmt1Q9JIF0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prmt1Q9JIF0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prmt1Q9JIF0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prmt1Q9JIF0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prmt1Q9JIF0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prmt1Q9JIF0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prmt1Q9JIF0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prmt1Q9JIF0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prmt1Q9JIF0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prmt1Q9JIF0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prmt1Q9JIF0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prmt1Q9JIF0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prmt1Q9JIF0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prmt1Q9JIF0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prmt1Q9JIF0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prmt1Q9JIF0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prmt1Q9JIF0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prmt1Q9JIF0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prmt1Q9JIF0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prmt1Q9JIF0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prmt1Q9JIF0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prmt1Q9JIF0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prmt1Q9JIF0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prmt1Q9JIF0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prmt1Q9JIF0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prmt1Q9JIF0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prmt1Q9JIF0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prmt1Q9JIF0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prmt1Q9JIF0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prmt1Q9JIF0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prmt1Q9JIF0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Prmt1Q9JIF0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Prmt1Q9JIF0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prmt1Q9JIF0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Prmt1Q9JIF0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prmt1Q9JIF0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prmt1Q9JIF0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prmt1Q9JIF0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prmt1Q9JIF0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prmt1Q9JIF0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prmt1Q9JIF0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prmt1Q9JIF0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prmt1Q9JIF0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Prmt1Q9JIF0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prmt1Q9JIF0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prmt1Q9JIF0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prmt1Q9JIF0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prmt1Q9JIF0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prmt1Q9JIF0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prmt1Q9JIF0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prmt1Q9JIF0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prmt1Q9JIF0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prmt1Q9JIF0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prmt1Q9JIF0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prmt1Q9JIF0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prmt1Q9JIF0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prmt1Q9JIF0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prmt1Q9JIF0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prmt1Q9JIF0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prmt1Q9JIF0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prmt1Q9JIF0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prmt1Q9JIF0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prmt1Q9JIF0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prmt1Q9JIF0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prmt1Q9JIF0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prmt1Q9JIF0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prmt1Q9JIF0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prmt1Q9JIF0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Prmt1Q9JIF0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prmt1Q9JIF0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms