Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPT1

Vmn1r63, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r63Q9EPT1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r63Q9EPT1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r63Q9EPT1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms