Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smg9Q9DB90 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smg9Q9DB90 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smg9Q9DB90 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smg9Q9DB90 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smg9Q9DB90 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smg9Q9DB90 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smg9Q9DB90 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smg9Q9DB90 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smg9Q9DB90 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smg9Q9DB90 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smg9Q9DB90 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smg9Q9DB90 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Smg9Q9DB90 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smg9Q9DB90 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smg9Q9DB90 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smg9Q9DB90 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smg9Q9DB90 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smg9Q9DB90 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smg9Q9DB90 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smg9Q9DB90 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smg9Q9DB90 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smg9Q9DB90 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smg9Q9DB90 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smg9Q9DB90 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smg9Q9DB90 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smg9Q9DB90 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smg9Q9DB90 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smg9Q9DB90 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smg9Q9DB90 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smg9Q9DB90 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smg9Q9DB90 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smg9Q9DB90 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smg9Q9DB90 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smg9Q9DB90 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smg9Q9DB90 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smg9Q9DB90 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Smg9Q9DB90 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Smg9Q9DB90 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Smg9Q9DB90 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Smg9Q9DB90 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Smg9Q9DB90 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smg9Q9DB90 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smg9Q9DB90 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smg9Q9DB90 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smg9Q9DB90 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smg9Q9DB90 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smg9Q9DB90 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smg9Q9DB90 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smg9Q9DB90 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smg9Q9DB90 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smg9Q9DB90 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smg9Q9DB90 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smg9Q9DB90 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smg9Q9DB90 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smg9Q9DB90 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smg9Q9DB90 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smg9Q9DB90 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Smg9Q9DB90 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smg9Q9DB90 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Smg9Q9DB90 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smg9Q9DB90 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smg9Q9DB90 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smg9Q9DB90 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smg9Q9DB90 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smg9Q9DB90 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smg9Q9DB90 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smg9Q9DB90 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smg9Q9DB90 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smg9Q9DB90 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smg9Q9DB90 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smg9Q9DB90 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smg9Q9DB90 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smg9Q9DB90 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smg9Q9DB90 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smg9Q9DB90 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smg9Q9DB90 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smg9Q9DB90 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smg9Q9DB90 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smg9Q9DB90 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smg9Q9DB90 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smg9Q9DB90 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smg9Q9DB90 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Smg9Q9DB90 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smg9Q9DB90 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smg9Q9DB90 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smg9Q9DB90 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smg9Q9DB90 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smg9Q9DB90 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smg9Q9DB90 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smg9Q9DB90 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smg9Q9DB90 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smg9Q9DB90 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smg9Q9DB90 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smg9Q9DB90 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smg9Q9DB90 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smg9Q9DB90 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Smg9Q9DB90 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Smg9Q9DB90 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Smg9Q9DB90 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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