Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAH1

Scp2d1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scp2d1Q9DAH1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scp2d1Q9DAH1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scp2d1Q9DAH1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scp2d1Q9DAH1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scp2d1Q9DAH1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scp2d1Q9DAH1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scp2d1Q9DAH1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scp2d1Q9DAH1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scp2d1Q9DAH1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scp2d1Q9DAH1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scp2d1Q9DAH1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms