Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rexo2Q9D8S4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rexo2Q9D8S4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rexo2Q9D8S4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rexo2Q9D8S4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rexo2Q9D8S4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rexo2Q9D8S4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rexo2Q9D8S4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rexo2Q9D8S4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rexo2Q9D8S4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rexo2Q9D8S4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rexo2Q9D8S4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rexo2Q9D8S4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rexo2Q9D8S4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rexo2Q9D8S4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rexo2Q9D8S4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rexo2Q9D8S4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rexo2Q9D8S4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rexo2Q9D8S4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rexo2Q9D8S4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rexo2Q9D8S4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rexo2Q9D8S4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rexo2Q9D8S4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rexo2Q9D8S4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rexo2Q9D8S4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rexo2Q9D8S4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rexo2Q9D8S4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rexo2Q9D8S4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rexo2Q9D8S4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rexo2Q9D8S4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rexo2Q9D8S4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Rexo2Q9D8S4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rexo2Q9D8S4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rexo2Q9D8S4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rexo2Q9D8S4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rexo2Q9D8S4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rexo2Q9D8S4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rexo2Q9D8S4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rexo2Q9D8S4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rexo2Q9D8S4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rexo2Q9D8S4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rexo2Q9D8S4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rexo2Q9D8S4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rexo2Q9D8S4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rexo2Q9D8S4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rexo2Q9D8S4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rexo2Q9D8S4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rexo2Q9D8S4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rexo2Q9D8S4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rexo2Q9D8S4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rexo2Q9D8S4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rexo2Q9D8S4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rexo2Q9D8S4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rexo2Q9D8S4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rexo2Q9D8S4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rexo2Q9D8S4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Rexo2Q9D8S4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rexo2Q9D8S4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rexo2Q9D8S4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rexo2Q9D8S4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rexo2Q9D8S4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Rexo2Q9D8S4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rexo2Q9D8S4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rexo2Q9D8S4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rexo2Q9D8S4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rexo2Q9D8S4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rexo2Q9D8S4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rexo2Q9D8S4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rexo2Q9D8S4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rexo2Q9D8S4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rexo2Q9D8S4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rexo2Q9D8S4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rexo2Q9D8S4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rexo2Q9D8S4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rexo2Q9D8S4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rexo2Q9D8S4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rexo2Q9D8S4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rexo2Q9D8S4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rexo2Q9D8S4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rexo2Q9D8S4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rexo2Q9D8S4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rexo2Q9D8S4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rexo2Q9D8S4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rexo2Q9D8S4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rexo2Q9D8S4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rexo2Q9D8S4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Rexo2Q9D8S4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rexo2Q9D8S4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rexo2Q9D8S4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rexo2Q9D8S4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rexo2Q9D8S4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rexo2Q9D8S4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rexo2Q9D8S4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rexo2Q9D8S4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rexo2Q9D8S4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rexo2Q9D8S4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rexo2Q9D8S4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Rexo2Q9D8S4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rexo2Q9D8S4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rexo2Q9D8S4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms