Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B7

Jam3, Junctional adhesion molecule C, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jam3Q9D8B7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Jam3Q9D8B7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Jam3Q9D8B7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Jam3Q9D8B7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Jam3Q9D8B7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Jam3Q9D8B7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Jam3Q9D8B7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Jam3Q9D8B7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Jam3Q9D8B7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Jam3Q9D8B7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Jam3Q9D8B7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Jam3Q9D8B7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Jam3Q9D8B7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Jam3Q9D8B7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Jam3Q9D8B7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Jam3Q9D8B7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Jam3Q9D8B7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Jam3Q9D8B7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Jam3Q9D8B7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Jam3Q9D8B7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Jam3Q9D8B7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Jam3Q9D8B7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Jam3Q9D8B7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Jam3Q9D8B7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Jam3Q9D8B7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Jam3Q9D8B7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Jam3Q9D8B7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Jam3Q9D8B7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Jam3Q9D8B7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Jam3Q9D8B7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Jam3Q9D8B7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Jam3Q9D8B7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Jam3Q9D8B7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Jam3Q9D8B7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Jam3Q9D8B7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Jam3Q9D8B7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Jam3Q9D8B7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Jam3Q9D8B7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Jam3Q9D8B7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Jam3Q9D8B7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Jam3Q9D8B7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Jam3Q9D8B7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Jam3Q9D8B7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Jam3Q9D8B7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Jam3Q9D8B7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Jam3Q9D8B7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Jam3Q9D8B7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Jam3Q9D8B7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Jam3Q9D8B7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Jam3Q9D8B7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Jam3Q9D8B7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Jam3Q9D8B7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Jam3Q9D8B7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Jam3Q9D8B7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Jam3Q9D8B7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Jam3Q9D8B7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Jam3Q9D8B7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Jam3Q9D8B7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Jam3Q9D8B7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Jam3Q9D8B7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Jam3Q9D8B7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Jam3Q9D8B7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Jam3Q9D8B7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Jam3Q9D8B7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Jam3Q9D8B7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Jam3Q9D8B7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Jam3Q9D8B7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Jam3Q9D8B7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Jam3Q9D8B7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Jam3Q9D8B7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Jam3Q9D8B7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Jam3Q9D8B7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Jam3Q9D8B7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Jam3Q9D8B7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Jam3Q9D8B7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Jam3Q9D8B7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Jam3Q9D8B7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Jam3Q9D8B7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Jam3Q9D8B7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Jam3Q9D8B7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Jam3Q9D8B7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Jam3Q9D8B7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Jam3Q9D8B7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Jam3Q9D8B7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Jam3Q9D8B7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Jam3Q9D8B7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Jam3Q9D8B7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Jam3Q9D8B7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Jam3Q9D8B7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Jam3Q9D8B7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Jam3Q9D8B7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Jam3Q9D8B7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Jam3Q9D8B7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Jam3Q9D8B7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Jam3Q9D8B7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Jam3Q9D8B7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Jam3Q9D8B7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Jam3Q9D8B7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Jam3Q9D8B7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Jam3Q9D8B7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms