Protein–RNA interactions for Protein: Q9D880

Timm50, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM50, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm50Q9D880 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Timm50Q9D880 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Timm50Q9D880 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Timm50Q9D880 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Timm50Q9D880 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Timm50Q9D880 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Timm50Q9D880 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Timm50Q9D880 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Timm50Q9D880 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Timm50Q9D880 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Timm50Q9D880 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Timm50Q9D880 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Timm50Q9D880 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Timm50Q9D880 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Timm50Q9D880 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Timm50Q9D880 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Timm50Q9D880 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Timm50Q9D880 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Timm50Q9D880 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Timm50Q9D880 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Timm50Q9D880 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Timm50Q9D880 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Timm50Q9D880 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Timm50Q9D880 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Timm50Q9D880 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Timm50Q9D880 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Timm50Q9D880 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Timm50Q9D880 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Timm50Q9D880 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Timm50Q9D880 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Timm50Q9D880 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Timm50Q9D880 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Timm50Q9D880 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Timm50Q9D880 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Timm50Q9D880 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Timm50Q9D880 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Timm50Q9D880 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Timm50Q9D880 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Timm50Q9D880 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Timm50Q9D880 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Timm50Q9D880 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Timm50Q9D880 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Timm50Q9D880 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Timm50Q9D880 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Timm50Q9D880 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Timm50Q9D880 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Timm50Q9D880 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Timm50Q9D880 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Timm50Q9D880 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Timm50Q9D880 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Timm50Q9D880 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Timm50Q9D880 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Timm50Q9D880 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Timm50Q9D880 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Timm50Q9D880 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Timm50Q9D880 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Timm50Q9D880 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Timm50Q9D880 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Timm50Q9D880 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Timm50Q9D880 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Timm50Q9D880 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Timm50Q9D880 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Timm50Q9D880 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Timm50Q9D880 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Timm50Q9D880 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Timm50Q9D880 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Timm50Q9D880 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Timm50Q9D880 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Timm50Q9D880 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Timm50Q9D880 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Timm50Q9D880 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Timm50Q9D880 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Timm50Q9D880 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Timm50Q9D880 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Timm50Q9D880 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Timm50Q9D880 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Timm50Q9D880 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Timm50Q9D880 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Timm50Q9D880 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Timm50Q9D880 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Timm50Q9D880 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Timm50Q9D880 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Timm50Q9D880 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Timm50Q9D880 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Timm50Q9D880 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Timm50Q9D880 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Timm50Q9D880 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Timm50Q9D880 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Timm50Q9D880 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Timm50Q9D880 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Timm50Q9D880 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Timm50Q9D880 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Timm50Q9D880 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Timm50Q9D880 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Timm50Q9D880 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Timm50Q9D880 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Timm50Q9D880 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Timm50Q9D880 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Timm50Q9D880 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Timm50Q9D880 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms