Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7T1

Rep15, Rab15 effector protein, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rep15Q9D7T1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rep15Q9D7T1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rep15Q9D7T1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rep15Q9D7T1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rep15Q9D7T1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rep15Q9D7T1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rep15Q9D7T1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rep15Q9D7T1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rep15Q9D7T1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rep15Q9D7T1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rep15Q9D7T1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rep15Q9D7T1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rep15Q9D7T1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rep15Q9D7T1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rep15Q9D7T1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rep15Q9D7T1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rep15Q9D7T1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rep15Q9D7T1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rep15Q9D7T1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rep15Q9D7T1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rep15Q9D7T1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rep15Q9D7T1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rep15Q9D7T1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rep15Q9D7T1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rep15Q9D7T1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rep15Q9D7T1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rep15Q9D7T1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rep15Q9D7T1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rep15Q9D7T1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rep15Q9D7T1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rep15Q9D7T1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rep15Q9D7T1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rep15Q9D7T1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rep15Q9D7T1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rep15Q9D7T1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rep15Q9D7T1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rep15Q9D7T1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rep15Q9D7T1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rep15Q9D7T1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rep15Q9D7T1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rep15Q9D7T1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rep15Q9D7T1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rep15Q9D7T1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rep15Q9D7T1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rep15Q9D7T1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rep15Q9D7T1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rep15Q9D7T1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rep15Q9D7T1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rep15Q9D7T1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rep15Q9D7T1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rep15Q9D7T1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rep15Q9D7T1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rep15Q9D7T1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rep15Q9D7T1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rep15Q9D7T1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rep15Q9D7T1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rep15Q9D7T1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rep15Q9D7T1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rep15Q9D7T1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rep15Q9D7T1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rep15Q9D7T1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Rep15Q9D7T1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Rep15Q9D7T1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Rep15Q9D7T1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rep15Q9D7T1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rep15Q9D7T1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rep15Q9D7T1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rep15Q9D7T1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rep15Q9D7T1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rep15Q9D7T1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rep15Q9D7T1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rep15Q9D7T1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rep15Q9D7T1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rep15Q9D7T1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rep15Q9D7T1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rep15Q9D7T1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rep15Q9D7T1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rep15Q9D7T1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rep15Q9D7T1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rep15Q9D7T1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rep15Q9D7T1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rep15Q9D7T1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rep15Q9D7T1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rep15Q9D7T1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rep15Q9D7T1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rep15Q9D7T1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rep15Q9D7T1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rep15Q9D7T1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rep15Q9D7T1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rep15Q9D7T1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rep15Q9D7T1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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