Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhl40Q9D783 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhl40Q9D783 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhl40Q9D783 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Klhl40Q9D783 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klhl40Q9D783 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klhl40Q9D783 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klhl40Q9D783 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klhl40Q9D783 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klhl40Q9D783 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klhl40Q9D783 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klhl40Q9D783 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klhl40Q9D783 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klhl40Q9D783 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klhl40Q9D783 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klhl40Q9D783 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klhl40Q9D783 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klhl40Q9D783 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klhl40Q9D783 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klhl40Q9D783 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klhl40Q9D783 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhl40Q9D783 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhl40Q9D783 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhl40Q9D783 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhl40Q9D783 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhl40Q9D783 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhl40Q9D783 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhl40Q9D783 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhl40Q9D783 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhl40Q9D783 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhl40Q9D783 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhl40Q9D783 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klhl40Q9D783 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klhl40Q9D783 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klhl40Q9D783 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klhl40Q9D783 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klhl40Q9D783 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klhl40Q9D783 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klhl40Q9D783 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klhl40Q9D783 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klhl40Q9D783 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Klhl40Q9D783 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klhl40Q9D783 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klhl40Q9D783 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klhl40Q9D783 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klhl40Q9D783 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klhl40Q9D783 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klhl40Q9D783 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klhl40Q9D783 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klhl40Q9D783 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Klhl40Q9D783 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Klhl40Q9D783 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Klhl40Q9D783 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klhl40Q9D783 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klhl40Q9D783 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klhl40Q9D783 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Klhl40Q9D783 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klhl40Q9D783 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klhl40Q9D783 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klhl40Q9D783 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klhl40Q9D783 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klhl40Q9D783 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klhl40Q9D783 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klhl40Q9D783 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhl40Q9D783 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhl40Q9D783 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhl40Q9D783 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhl40Q9D783 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhl40Q9D783 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhl40Q9D783 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhl40Q9D783 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhl40Q9D783 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhl40Q9D783 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhl40Q9D783 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl40Q9D783 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl40Q9D783 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl40Q9D783 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl40Q9D783 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl40Q9D783 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl40Q9D783 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl40Q9D783 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl40Q9D783 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl40Q9D783 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl40Q9D783 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl40Q9D783 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl40Q9D783 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl40Q9D783 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhl40Q9D783 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhl40Q9D783 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhl40Q9D783 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhl40Q9D783 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhl40Q9D783 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhl40Q9D783 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhl40Q9D783 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhl40Q9D783 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhl40Q9D783 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhl40Q9D783 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhl40Q9D783 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhl40Q9D783 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhl40Q9D783 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms