Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc81Q9D5W4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc81Q9D5W4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc81Q9D5W4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc81Q9D5W4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc81Q9D5W4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc81Q9D5W4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc81Q9D5W4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc81Q9D5W4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc81Q9D5W4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc81Q9D5W4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc81Q9D5W4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc81Q9D5W4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc81Q9D5W4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc81Q9D5W4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc81Q9D5W4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc81Q9D5W4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc81Q9D5W4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc81Q9D5W4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc81Q9D5W4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc81Q9D5W4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc81Q9D5W4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc81Q9D5W4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc81Q9D5W4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc81Q9D5W4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc81Q9D5W4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc81Q9D5W4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc81Q9D5W4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc81Q9D5W4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc81Q9D5W4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc81Q9D5W4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc81Q9D5W4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc81Q9D5W4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc81Q9D5W4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc81Q9D5W4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc81Q9D5W4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc81Q9D5W4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc81Q9D5W4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc81Q9D5W4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc81Q9D5W4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc81Q9D5W4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc81Q9D5W4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc81Q9D5W4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc81Q9D5W4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc81Q9D5W4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc81Q9D5W4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc81Q9D5W4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc81Q9D5W4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc81Q9D5W4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc81Q9D5W4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc81Q9D5W4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc81Q9D5W4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc81Q9D5W4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc81Q9D5W4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc81Q9D5W4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc81Q9D5W4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc81Q9D5W4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc81Q9D5W4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc81Q9D5W4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc81Q9D5W4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc81Q9D5W4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc81Q9D5W4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc81Q9D5W4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc81Q9D5W4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc81Q9D5W4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc81Q9D5W4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc81Q9D5W4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc81Q9D5W4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc81Q9D5W4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc81Q9D5W4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc81Q9D5W4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc81Q9D5W4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc81Q9D5W4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc81Q9D5W4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc81Q9D5W4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc81Q9D5W4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc81Q9D5W4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc81Q9D5W4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc81Q9D5W4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc81Q9D5W4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc81Q9D5W4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc81Q9D5W4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc81Q9D5W4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc81Q9D5W4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc81Q9D5W4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc81Q9D5W4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc81Q9D5W4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc81Q9D5W4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc81Q9D5W4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc81Q9D5W4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc81Q9D5W4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc81Q9D5W4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc81Q9D5W4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc81Q9D5W4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc81Q9D5W4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc81Q9D5W4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc81Q9D5W4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms