Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D4W2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D4W2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D4W2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D4W2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D4W2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D4W2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D4W2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D4W2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D4W2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D4W2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D4W2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D4W2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D4W2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D4W2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D4W2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D4W2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D4W2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D4W2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D4W2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D4W2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D4W2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D4W2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D4W2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D4W2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D4W2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D4W2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D4W2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D4W2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D4W2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D4W2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D4W2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D4W2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D4W2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D4W2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D4W2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D4W2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D4W2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D4W2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D4W2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D4W2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D4W2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D4W2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D4W2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D4W2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D4W2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D4W2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D4W2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D4W2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D4W2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D4W2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D4W2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D4W2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D4W2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D4W2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D4W2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D4W2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D4W2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D4W2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D4W2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D4W2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D4W2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D4W2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D4W2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D4W2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D4W2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D4W2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D4W2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D4W2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D4W2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D4W2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D4W2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D4W2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D4W2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D4W2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D4W2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D4W2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D4W2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D4W2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D4W2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D4W2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D4W2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D4W2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D4W2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D4W2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D4W2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q9D4W2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q9D4W2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q9D4W2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q9D4W2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D4W2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D4W2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D4W2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D4W2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D4W2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D4W2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D4W2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D4W2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D4W2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D4W2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms