Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q1

Ribc2, RIB43A-like with coiled-coils protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc2Q9D4Q1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ribc2Q9D4Q1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ribc2Q9D4Q1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ribc2Q9D4Q1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ribc2Q9D4Q1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ribc2Q9D4Q1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ribc2Q9D4Q1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ribc2Q9D4Q1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ribc2Q9D4Q1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ribc2Q9D4Q1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ribc2Q9D4Q1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ribc2Q9D4Q1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ribc2Q9D4Q1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ribc2Q9D4Q1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ribc2Q9D4Q1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ribc2Q9D4Q1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ribc2Q9D4Q1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ribc2Q9D4Q1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ribc2Q9D4Q1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ribc2Q9D4Q1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ribc2Q9D4Q1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ribc2Q9D4Q1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ribc2Q9D4Q1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ribc2Q9D4Q1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ribc2Q9D4Q1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ribc2Q9D4Q1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ribc2Q9D4Q1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ribc2Q9D4Q1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ribc2Q9D4Q1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ribc2Q9D4Q1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ribc2Q9D4Q1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ribc2Q9D4Q1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ribc2Q9D4Q1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ribc2Q9D4Q1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ribc2Q9D4Q1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ribc2Q9D4Q1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ribc2Q9D4Q1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ribc2Q9D4Q1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ribc2Q9D4Q1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ribc2Q9D4Q1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ribc2Q9D4Q1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ribc2Q9D4Q1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ribc2Q9D4Q1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ribc2Q9D4Q1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ribc2Q9D4Q1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ribc2Q9D4Q1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ribc2Q9D4Q1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ribc2Q9D4Q1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ribc2Q9D4Q1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ribc2Q9D4Q1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ribc2Q9D4Q1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ribc2Q9D4Q1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ribc2Q9D4Q1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ribc2Q9D4Q1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ribc2Q9D4Q1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ribc2Q9D4Q1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ribc2Q9D4Q1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ribc2Q9D4Q1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ribc2Q9D4Q1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ribc2Q9D4Q1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ribc2Q9D4Q1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ribc2Q9D4Q1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ribc2Q9D4Q1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ribc2Q9D4Q1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ribc2Q9D4Q1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ribc2Q9D4Q1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ribc2Q9D4Q1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ribc2Q9D4Q1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ribc2Q9D4Q1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ribc2Q9D4Q1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ribc2Q9D4Q1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ribc2Q9D4Q1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ribc2Q9D4Q1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ribc2Q9D4Q1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ribc2Q9D4Q1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ribc2Q9D4Q1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ribc2Q9D4Q1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ribc2Q9D4Q1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ribc2Q9D4Q1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ribc2Q9D4Q1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ribc2Q9D4Q1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ribc2Q9D4Q1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ribc2Q9D4Q1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ribc2Q9D4Q1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ribc2Q9D4Q1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ribc2Q9D4Q1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ribc2Q9D4Q1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ribc2Q9D4Q1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ribc2Q9D4Q1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ribc2Q9D4Q1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ribc2Q9D4Q1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ribc2Q9D4Q1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ribc2Q9D4Q1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ribc2Q9D4Q1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ribc2Q9D4Q1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ribc2Q9D4Q1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ribc2Q9D4Q1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ribc2Q9D4Q1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ribc2Q9D4Q1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ribc2Q9D4Q1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms