Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
4933428M09RikQ9D3X3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4933428M09RikQ9D3X3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4933428M09RikQ9D3X3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4933428M09RikQ9D3X3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4933428M09RikQ9D3X3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4933428M09RikQ9D3X3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4933428M09RikQ9D3X3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
4933428M09RikQ9D3X3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
4933428M09RikQ9D3X3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4933428M09RikQ9D3X3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4933428M09RikQ9D3X3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4933428M09RikQ9D3X3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
4933428M09RikQ9D3X3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
4933428M09RikQ9D3X3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4933428M09RikQ9D3X3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4933428M09RikQ9D3X3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
4933428M09RikQ9D3X3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
4933428M09RikQ9D3X3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
4933428M09RikQ9D3X3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
4933428M09RikQ9D3X3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
4933428M09RikQ9D3X3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
4933428M09RikQ9D3X3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
4933428M09RikQ9D3X3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
4933428M09RikQ9D3X3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
4933428M09RikQ9D3X3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
4933428M09RikQ9D3X3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
4933428M09RikQ9D3X3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
4933428M09RikQ9D3X3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
4933428M09RikQ9D3X3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
4933428M09RikQ9D3X3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
4933428M09RikQ9D3X3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
4933428M09RikQ9D3X3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
4933428M09RikQ9D3X3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
4933428M09RikQ9D3X3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
4933428M09RikQ9D3X3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
4933428M09RikQ9D3X3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
4933428M09RikQ9D3X3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
4933428M09RikQ9D3X3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
4933428M09RikQ9D3X3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
4933428M09RikQ9D3X3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
4933428M09RikQ9D3X3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
4933428M09RikQ9D3X3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
4933428M09RikQ9D3X3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
4933428M09RikQ9D3X3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
4933428M09RikQ9D3X3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
4933428M09RikQ9D3X3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
4933428M09RikQ9D3X3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
4933428M09RikQ9D3X3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
4933428M09RikQ9D3X3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
4933428M09RikQ9D3X3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
4933428M09RikQ9D3X3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
4933428M09RikQ9D3X3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
4933428M09RikQ9D3X3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
4933428M09RikQ9D3X3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
4933428M09RikQ9D3X3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
4933428M09RikQ9D3X3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
4933428M09RikQ9D3X3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
4933428M09RikQ9D3X3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
4933428M09RikQ9D3X3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
4933428M09RikQ9D3X3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
4933428M09RikQ9D3X3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
4933428M09RikQ9D3X3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
4933428M09RikQ9D3X3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
4933428M09RikQ9D3X3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
4933428M09RikQ9D3X3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
4933428M09RikQ9D3X3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
4933428M09RikQ9D3X3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
4933428M09RikQ9D3X3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
4933428M09RikQ9D3X3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
4933428M09RikQ9D3X3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
4933428M09RikQ9D3X3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
4933428M09RikQ9D3X3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
4933428M09RikQ9D3X3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
4933428M09RikQ9D3X3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
4933428M09RikQ9D3X3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
4933428M09RikQ9D3X3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
4933428M09RikQ9D3X3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
4933428M09RikQ9D3X3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
4933428M09RikQ9D3X3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
4933428M09RikQ9D3X3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
4933428M09RikQ9D3X3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
4933428M09RikQ9D3X3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
4933428M09RikQ9D3X3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
4933428M09RikQ9D3X3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
4933428M09RikQ9D3X3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
4933428M09RikQ9D3X3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
4933428M09RikQ9D3X3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
4933428M09RikQ9D3X3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
4933428M09RikQ9D3X3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
4933428M09RikQ9D3X3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
4933428M09RikQ9D3X3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
4933428M09RikQ9D3X3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
4933428M09RikQ9D3X3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
4933428M09RikQ9D3X3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19■□□□□ 0.63
4933428M09RikQ9D3X3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
4933428M09RikQ9D3X3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms