Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx29Q9D3S3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx29Q9D3S3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx29Q9D3S3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx29Q9D3S3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx29Q9D3S3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx29Q9D3S3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx29Q9D3S3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx29Q9D3S3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx29Q9D3S3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx29Q9D3S3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx29Q9D3S3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx29Q9D3S3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx29Q9D3S3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx29Q9D3S3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snx29Q9D3S3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snx29Q9D3S3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snx29Q9D3S3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Snx29Q9D3S3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snx29Q9D3S3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snx29Q9D3S3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snx29Q9D3S3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snx29Q9D3S3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snx29Q9D3S3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snx29Q9D3S3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snx29Q9D3S3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snx29Q9D3S3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snx29Q9D3S3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx29Q9D3S3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx29Q9D3S3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx29Q9D3S3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx29Q9D3S3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx29Q9D3S3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx29Q9D3S3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx29Q9D3S3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx29Q9D3S3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx29Q9D3S3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx29Q9D3S3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx29Q9D3S3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx29Q9D3S3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx29Q9D3S3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx29Q9D3S3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx29Q9D3S3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx29Q9D3S3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx29Q9D3S3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx29Q9D3S3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx29Q9D3S3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx29Q9D3S3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx29Q9D3S3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx29Q9D3S3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx29Q9D3S3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx29Q9D3S3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx29Q9D3S3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx29Q9D3S3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx29Q9D3S3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx29Q9D3S3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx29Q9D3S3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx29Q9D3S3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx29Q9D3S3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx29Q9D3S3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx29Q9D3S3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx29Q9D3S3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx29Q9D3S3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx29Q9D3S3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx29Q9D3S3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx29Q9D3S3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx29Q9D3S3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx29Q9D3S3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx29Q9D3S3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx29Q9D3S3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx29Q9D3S3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx29Q9D3S3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx29Q9D3S3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx29Q9D3S3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx29Q9D3S3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx29Q9D3S3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx29Q9D3S3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx29Q9D3S3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx29Q9D3S3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx29Q9D3S3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx29Q9D3S3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Snx29Q9D3S3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Snx29Q9D3S3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Snx29Q9D3S3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snx29Q9D3S3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snx29Q9D3S3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snx29Q9D3S3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx29Q9D3S3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx29Q9D3S3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx29Q9D3S3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx29Q9D3S3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx29Q9D3S3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx29Q9D3S3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx29Q9D3S3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx29Q9D3S3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx29Q9D3S3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx29Q9D3S3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx29Q9D3S3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx29Q9D3S3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx29Q9D3S3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.2 ms