Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

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Length 321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Fndc8Q9D2H8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fndc8Q9D2H8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fndc8Q9D2H8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fndc8Q9D2H8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fndc8Q9D2H8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fndc8Q9D2H8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fndc8Q9D2H8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fndc8Q9D2H8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fndc8Q9D2H8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fndc8Q9D2H8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fndc8Q9D2H8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fndc8Q9D2H8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fndc8Q9D2H8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fndc8Q9D2H8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fndc8Q9D2H8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fndc8Q9D2H8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fndc8Q9D2H8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fndc8Q9D2H8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fndc8Q9D2H8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fndc8Q9D2H8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fndc8Q9D2H8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fndc8Q9D2H8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fndc8Q9D2H8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fndc8Q9D2H8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fndc8Q9D2H8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fndc8Q9D2H8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fndc8Q9D2H8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fndc8Q9D2H8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fndc8Q9D2H8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fndc8Q9D2H8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fndc8Q9D2H8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fndc8Q9D2H8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fndc8Q9D2H8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fndc8Q9D2H8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fndc8Q9D2H8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fndc8Q9D2H8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fndc8Q9D2H8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fndc8Q9D2H8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fndc8Q9D2H8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fndc8Q9D2H8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fndc8Q9D2H8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fndc8Q9D2H8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fndc8Q9D2H8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fndc8Q9D2H8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fndc8Q9D2H8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fndc8Q9D2H8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fndc8Q9D2H8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Fndc8Q9D2H8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Fndc8Q9D2H8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fndc8Q9D2H8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fndc8Q9D2H8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fndc8Q9D2H8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fndc8Q9D2H8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fndc8Q9D2H8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fndc8Q9D2H8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fndc8Q9D2H8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Fndc8Q9D2H8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fndc8Q9D2H8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fndc8Q9D2H8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fndc8Q9D2H8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fndc8Q9D2H8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fndc8Q9D2H8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Fndc8Q9D2H8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fndc8Q9D2H8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fndc8Q9D2H8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fndc8Q9D2H8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Fndc8Q9D2H8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fndc8Q9D2H8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fndc8Q9D2H8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fndc8Q9D2H8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fndc8Q9D2H8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fndc8Q9D2H8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fndc8Q9D2H8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fndc8Q9D2H8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fndc8Q9D2H8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fndc8Q9D2H8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fndc8Q9D2H8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fndc8Q9D2H8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fndc8Q9D2H8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fndc8Q9D2H8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Fndc8Q9D2H8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fndc8Q9D2H8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fndc8Q9D2H8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fndc8Q9D2H8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fndc8Q9D2H8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fndc8Q9D2H8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fndc8Q9D2H8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fndc8Q9D2H8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fndc8Q9D2H8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fndc8Q9D2H8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fndc8Q9D2H8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fndc8Q9D2H8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fndc8Q9D2H8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fndc8Q9D2H8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fndc8Q9D2H8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fndc8Q9D2H8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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