Protein–RNA interactions for Protein: Q9D260

9230112D13Rik, RIKEN cDNA 9230112D13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9230112D13RikQ9D260 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
9230112D13RikQ9D260 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
9230112D13RikQ9D260 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
9230112D13RikQ9D260 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
9230112D13RikQ9D260 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
9230112D13RikQ9D260 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
9230112D13RikQ9D260 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
9230112D13RikQ9D260 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
9230112D13RikQ9D260 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
9230112D13RikQ9D260 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
9230112D13RikQ9D260 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
9230112D13RikQ9D260 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
9230112D13RikQ9D260 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
9230112D13RikQ9D260 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
9230112D13RikQ9D260 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
9230112D13RikQ9D260 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
9230112D13RikQ9D260 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
9230112D13RikQ9D260 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
9230112D13RikQ9D260 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
9230112D13RikQ9D260 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
9230112D13RikQ9D260 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
9230112D13RikQ9D260 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
9230112D13RikQ9D260 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
9230112D13RikQ9D260 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
9230112D13RikQ9D260 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
9230112D13RikQ9D260 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
9230112D13RikQ9D260 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
9230112D13RikQ9D260 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
9230112D13RikQ9D260 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
9230112D13RikQ9D260 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
9230112D13RikQ9D260 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
9230112D13RikQ9D260 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
9230112D13RikQ9D260 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
9230112D13RikQ9D260 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
9230112D13RikQ9D260 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
9230112D13RikQ9D260 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
9230112D13RikQ9D260 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
9230112D13RikQ9D260 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
9230112D13RikQ9D260 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
9230112D13RikQ9D260 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
9230112D13RikQ9D260 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
9230112D13RikQ9D260 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
9230112D13RikQ9D260 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
9230112D13RikQ9D260 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
9230112D13RikQ9D260 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
9230112D13RikQ9D260 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
9230112D13RikQ9D260 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
9230112D13RikQ9D260 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
9230112D13RikQ9D260 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
9230112D13RikQ9D260 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
9230112D13RikQ9D260 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
9230112D13RikQ9D260 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
9230112D13RikQ9D260 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
9230112D13RikQ9D260 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
9230112D13RikQ9D260 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
9230112D13RikQ9D260 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
9230112D13RikQ9D260 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
9230112D13RikQ9D260 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
9230112D13RikQ9D260 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
9230112D13RikQ9D260 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
9230112D13RikQ9D260 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
9230112D13RikQ9D260 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
9230112D13RikQ9D260 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
9230112D13RikQ9D260 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
9230112D13RikQ9D260 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
9230112D13RikQ9D260 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
9230112D13RikQ9D260 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
9230112D13RikQ9D260 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
9230112D13RikQ9D260 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
9230112D13RikQ9D260 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
9230112D13RikQ9D260 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
9230112D13RikQ9D260 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
9230112D13RikQ9D260 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
9230112D13RikQ9D260 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
9230112D13RikQ9D260 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
9230112D13RikQ9D260 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
9230112D13RikQ9D260 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
9230112D13RikQ9D260 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
9230112D13RikQ9D260 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
9230112D13RikQ9D260 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
9230112D13RikQ9D260 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
9230112D13RikQ9D260 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
9230112D13RikQ9D260 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
9230112D13RikQ9D260 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
9230112D13RikQ9D260 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
9230112D13RikQ9D260 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
9230112D13RikQ9D260 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
9230112D13RikQ9D260 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
9230112D13RikQ9D260 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
9230112D13RikQ9D260 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
9230112D13RikQ9D260 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
9230112D13RikQ9D260 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
9230112D13RikQ9D260 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
9230112D13RikQ9D260 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
9230112D13RikQ9D260 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
9230112D13RikQ9D260 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
9230112D13RikQ9D260 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
9230112D13RikQ9D260 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
9230112D13RikQ9D260 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
9230112D13RikQ9D260 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms