Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1Z3

Fam173b, Protein FAM173B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam173bQ9D1Z3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam173bQ9D1Z3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Fam173bQ9D1Z3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fam173bQ9D1Z3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fam173bQ9D1Z3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fam173bQ9D1Z3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fam173bQ9D1Z3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fam173bQ9D1Z3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam173bQ9D1Z3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam173bQ9D1Z3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam173bQ9D1Z3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam173bQ9D1Z3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam173bQ9D1Z3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam173bQ9D1Z3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam173bQ9D1Z3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms