Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9D1F3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9D1F3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9D1F3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9D1F3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9D1F3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9D1F3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9D1F3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9D1F3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9D1F3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9D1F3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9D1F3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9D1F3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9D1F3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q9D1F3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q9D1F3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9D1F3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9D1F3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9D1F3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9D1F3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9D1F3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9D1F3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9D1F3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9D1F3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9D1F3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9D1F3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9D1F3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9D1F3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9D1F3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9D1F3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9D1F3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9D1F3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9D1F3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9D1F3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9D1F3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9D1F3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9D1F3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9D1F3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9D1F3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9D1F3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9D1F3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9D1F3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9D1F3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9D1F3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9D1F3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9D1F3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9D1F3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9D1F3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9D1F3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9D1F3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9D1F3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9D1F3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9D1F3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9D1F3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9D1F3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9D1F3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9D1F3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9D1F3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q9D1F3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q9D1F3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q9D1F3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q9D1F3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q9D1F3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q9D1F3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q9D1F3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q9D1F3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q9D1F3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q9D1F3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q9D1F3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q9D1F3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q9D1F3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q9D1F3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q9D1F3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q9D1F3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Q9D1F3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Q9D1F3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q9D1F3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q9D1F3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Q9D1F3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q9D1F3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q9D1F3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q9D1F3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q9D1F3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q9D1F3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q9D1F3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q9D1F3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q9D1F3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q9D1F3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q9D1F3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q9D1F3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q9D1F3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q9D1F3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Q9D1F3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q9D1F3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q9D1F3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Q9D1F3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q9D1F3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q9D1F3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q9D1F3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q9D1F3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms