Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mrpl28Q9D1B9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mrpl28Q9D1B9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mrpl28Q9D1B9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mrpl28Q9D1B9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mrpl28Q9D1B9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mrpl28Q9D1B9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mrpl28Q9D1B9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mrpl28Q9D1B9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mrpl28Q9D1B9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mrpl28Q9D1B9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mrpl28Q9D1B9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Mrpl28Q9D1B9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mrpl28Q9D1B9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mrpl28Q9D1B9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mrpl28Q9D1B9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms