Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0E3

Lysmd1, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lysmd1Q9D0E3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lysmd1Q9D0E3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Lysmd1Q9D0E3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lysmd1Q9D0E3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Lysmd1Q9D0E3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lysmd1Q9D0E3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lysmd1Q9D0E3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lysmd1Q9D0E3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lysmd1Q9D0E3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lysmd1Q9D0E3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lysmd1Q9D0E3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lysmd1Q9D0E3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lysmd1Q9D0E3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lysmd1Q9D0E3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lysmd1Q9D0E3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lysmd1Q9D0E3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lysmd1Q9D0E3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lysmd1Q9D0E3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lysmd1Q9D0E3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lysmd1Q9D0E3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lysmd1Q9D0E3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lysmd1Q9D0E3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lysmd1Q9D0E3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lysmd1Q9D0E3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lysmd1Q9D0E3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lysmd1Q9D0E3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lysmd1Q9D0E3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Lysmd1Q9D0E3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lysmd1Q9D0E3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lysmd1Q9D0E3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lysmd1Q9D0E3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lysmd1Q9D0E3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Lysmd1Q9D0E3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lysmd1Q9D0E3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lysmd1Q9D0E3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lysmd1Q9D0E3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lysmd1Q9D0E3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lysmd1Q9D0E3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lysmd1Q9D0E3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lysmd1Q9D0E3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Lysmd1Q9D0E3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lysmd1Q9D0E3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lysmd1Q9D0E3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lysmd1Q9D0E3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lysmd1Q9D0E3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lysmd1Q9D0E3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lysmd1Q9D0E3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lysmd1Q9D0E3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lysmd1Q9D0E3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lysmd1Q9D0E3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lysmd1Q9D0E3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lysmd1Q9D0E3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lysmd1Q9D0E3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lysmd1Q9D0E3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lysmd1Q9D0E3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lysmd1Q9D0E3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lysmd1Q9D0E3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lysmd1Q9D0E3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lysmd1Q9D0E3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Lysmd1Q9D0E3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lysmd1Q9D0E3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lysmd1Q9D0E3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lysmd1Q9D0E3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lysmd1Q9D0E3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lysmd1Q9D0E3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lysmd1Q9D0E3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lysmd1Q9D0E3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lysmd1Q9D0E3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lysmd1Q9D0E3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lysmd1Q9D0E3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lysmd1Q9D0E3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lysmd1Q9D0E3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lysmd1Q9D0E3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lysmd1Q9D0E3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lysmd1Q9D0E3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lysmd1Q9D0E3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lysmd1Q9D0E3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lysmd1Q9D0E3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lysmd1Q9D0E3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lysmd1Q9D0E3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lysmd1Q9D0E3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lysmd1Q9D0E3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lysmd1Q9D0E3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lysmd1Q9D0E3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lysmd1Q9D0E3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Lysmd1Q9D0E3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lysmd1Q9D0E3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lysmd1Q9D0E3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lysmd1Q9D0E3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lysmd1Q9D0E3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lysmd1Q9D0E3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lysmd1Q9D0E3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lysmd1Q9D0E3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lysmd1Q9D0E3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lysmd1Q9D0E3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lysmd1Q9D0E3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lysmd1Q9D0E3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lysmd1Q9D0E3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lysmd1Q9D0E3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lysmd1Q9D0E3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms