Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ1

Utp11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp11Q9CZJ1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Utp11Q9CZJ1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Utp11Q9CZJ1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Utp11Q9CZJ1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Utp11Q9CZJ1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Utp11Q9CZJ1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Utp11Q9CZJ1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Utp11Q9CZJ1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Utp11Q9CZJ1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Utp11Q9CZJ1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Utp11Q9CZJ1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Utp11Q9CZJ1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Utp11Q9CZJ1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Utp11Q9CZJ1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Utp11Q9CZJ1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Utp11Q9CZJ1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Utp11Q9CZJ1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Utp11Q9CZJ1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Utp11Q9CZJ1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Utp11Q9CZJ1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Utp11Q9CZJ1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Utp11Q9CZJ1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Utp11Q9CZJ1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Utp11Q9CZJ1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Utp11Q9CZJ1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Utp11Q9CZJ1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Utp11Q9CZJ1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Utp11Q9CZJ1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Utp11Q9CZJ1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Utp11Q9CZJ1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Utp11Q9CZJ1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Utp11Q9CZJ1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Utp11Q9CZJ1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Utp11Q9CZJ1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Utp11Q9CZJ1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Utp11Q9CZJ1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Utp11Q9CZJ1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Utp11Q9CZJ1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Utp11Q9CZJ1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Utp11Q9CZJ1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Utp11Q9CZJ1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Utp11Q9CZJ1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Utp11Q9CZJ1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Utp11Q9CZJ1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Utp11Q9CZJ1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Utp11Q9CZJ1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Utp11Q9CZJ1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Utp11Q9CZJ1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Utp11Q9CZJ1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Utp11Q9CZJ1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Utp11Q9CZJ1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Utp11Q9CZJ1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Utp11Q9CZJ1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Utp11Q9CZJ1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Utp11Q9CZJ1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Utp11Q9CZJ1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Utp11Q9CZJ1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Utp11Q9CZJ1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Utp11Q9CZJ1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Utp11Q9CZJ1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Utp11Q9CZJ1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Utp11Q9CZJ1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Utp11Q9CZJ1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Utp11Q9CZJ1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Utp11Q9CZJ1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Utp11Q9CZJ1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Utp11Q9CZJ1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Utp11Q9CZJ1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Utp11Q9CZJ1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Utp11Q9CZJ1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Utp11Q9CZJ1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Utp11Q9CZJ1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Utp11Q9CZJ1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Utp11Q9CZJ1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Utp11Q9CZJ1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Utp11Q9CZJ1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Utp11Q9CZJ1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Utp11Q9CZJ1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Utp11Q9CZJ1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Utp11Q9CZJ1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Utp11Q9CZJ1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Utp11Q9CZJ1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Utp11Q9CZJ1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Utp11Q9CZJ1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Utp11Q9CZJ1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Utp11Q9CZJ1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Utp11Q9CZJ1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Utp11Q9CZJ1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Utp11Q9CZJ1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Utp11Q9CZJ1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Utp11Q9CZJ1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Utp11Q9CZJ1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Utp11Q9CZJ1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Utp11Q9CZJ1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Utp11Q9CZJ1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Utp11Q9CZJ1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Utp11Q9CZJ1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Utp11Q9CZJ1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Utp11Q9CZJ1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Utp11Q9CZJ1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms