Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Xrcc3Q9CXE6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xrcc3Q9CXE6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xrcc3Q9CXE6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xrcc3Q9CXE6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xrcc3Q9CXE6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xrcc3Q9CXE6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xrcc3Q9CXE6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xrcc3Q9CXE6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xrcc3Q9CXE6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xrcc3Q9CXE6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xrcc3Q9CXE6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Xrcc3Q9CXE6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xrcc3Q9CXE6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Xrcc3Q9CXE6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xrcc3Q9CXE6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Xrcc3Q9CXE6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xrcc3Q9CXE6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Xrcc3Q9CXE6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Xrcc3Q9CXE6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xrcc3Q9CXE6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Xrcc3Q9CXE6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Xrcc3Q9CXE6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Xrcc3Q9CXE6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Xrcc3Q9CXE6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Xrcc3Q9CXE6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Xrcc3Q9CXE6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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