Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUS9

Sppl3, Signal peptide peptidase-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl3Q9CUS9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sppl3Q9CUS9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Sppl3Q9CUS9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Sppl3Q9CUS9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sppl3Q9CUS9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sppl3Q9CUS9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sppl3Q9CUS9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sppl3Q9CUS9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sppl3Q9CUS9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sppl3Q9CUS9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sppl3Q9CUS9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sppl3Q9CUS9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sppl3Q9CUS9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sppl3Q9CUS9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Sppl3Q9CUS9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sppl3Q9CUS9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sppl3Q9CUS9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sppl3Q9CUS9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sppl3Q9CUS9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sppl3Q9CUS9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sppl3Q9CUS9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sppl3Q9CUS9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sppl3Q9CUS9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sppl3Q9CUS9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sppl3Q9CUS9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sppl3Q9CUS9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Sppl3Q9CUS9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sppl3Q9CUS9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sppl3Q9CUS9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sppl3Q9CUS9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sppl3Q9CUS9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sppl3Q9CUS9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sppl3Q9CUS9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sppl3Q9CUS9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sppl3Q9CUS9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sppl3Q9CUS9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sppl3Q9CUS9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sppl3Q9CUS9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sppl3Q9CUS9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sppl3Q9CUS9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sppl3Q9CUS9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Sppl3Q9CUS9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Sppl3Q9CUS9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sppl3Q9CUS9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sppl3Q9CUS9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sppl3Q9CUS9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sppl3Q9CUS9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sppl3Q9CUS9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sppl3Q9CUS9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sppl3Q9CUS9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sppl3Q9CUS9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sppl3Q9CUS9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sppl3Q9CUS9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sppl3Q9CUS9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sppl3Q9CUS9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sppl3Q9CUS9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sppl3Q9CUS9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sppl3Q9CUS9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sppl3Q9CUS9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sppl3Q9CUS9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Sppl3Q9CUS9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sppl3Q9CUS9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sppl3Q9CUS9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sppl3Q9CUS9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sppl3Q9CUS9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sppl3Q9CUS9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sppl3Q9CUS9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sppl3Q9CUS9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sppl3Q9CUS9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sppl3Q9CUS9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Sppl3Q9CUS9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Sppl3Q9CUS9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sppl3Q9CUS9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sppl3Q9CUS9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sppl3Q9CUS9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sppl3Q9CUS9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sppl3Q9CUS9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sppl3Q9CUS9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sppl3Q9CUS9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sppl3Q9CUS9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sppl3Q9CUS9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sppl3Q9CUS9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sppl3Q9CUS9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sppl3Q9CUS9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sppl3Q9CUS9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sppl3Q9CUS9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Sppl3Q9CUS9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sppl3Q9CUS9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sppl3Q9CUS9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sppl3Q9CUS9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sppl3Q9CUS9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sppl3Q9CUS9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sppl3Q9CUS9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sppl3Q9CUS9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sppl3Q9CUS9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sppl3Q9CUS9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sppl3Q9CUS9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sppl3Q9CUS9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Sppl3Q9CUS9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sppl3Q9CUS9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms